v2: Update validator
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Evaluación
- Dificultad
- 5/5
- Tiempo estimado
- Más de una semana
- Aptitud para principiantes
- 30/100
- Tipo de issue
- Nueva funcionalidad
- Claridad
- Necesita aclaración
- Estado de actividad
- Estancado
- Stack tecnológico
- python
- Área
- backend, testing-qa
Línea de trabajo
The issue identifies validation in petab.v2 but names no files or tests. Start by locating the v2 validator and its validation tests, then separate missing-column checks from the strict-mode and deserialization decisions. Done requires an agreed scope and completion of the selected checklist items without truncated or context-poor errors.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
So far, validation in petab.v2 is too lax and validator errors aren't too pretty and are often truncated.
- Readable error message
- include sufficient context in error messages
- Check for missing columns in files
- Consider using strict mode for validating files, but be more relaxed when programmatically constructing PEtab objects
- Decide whether we need to be able to de-serialize (somewhat) incorrect PEtab problems
- Lenguaje dominante
- Python
- Estrellas
- 18
- Forks
- 9
- Merge medio
- 2 d 4 h
- PR fusionados (30 d)
- 30
Preparar el entorno
- Sin Dockerfile ni archivo de Docker Compose
- Sin plantilla de pull request
- Leer la guía de contribución
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
Más de PEtab-dev/libpetab-python
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`petab_files_1to2` keeps a stale model file when converting into a non-empty output directoryAbierto
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