Regenerate the results for the mixed protocol tutorial

Đang mở
#355 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Maintainer thường phản hồi trong vòng 3 ngày

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
3/5
Thời gian dự kiến
1-2 ngày
Mức phù hợp với người mới
48/100
Loại issue
Tính năng
Độ rõ ràng
Khá rõ ràng
Mức độ hoạt động
Sôi nổi
Công nghệ
jupyter-notebook
Lĩnh vực
documentation

Hướng nghiên cứu

The results are in the example linked from PR #350; inspect that tutorial and its results files to identify the outdated data and how they are produced. Regenerate the results with newer openfe and alchemiscale versions, then update the example; verify the tutorial can extract names and phases from the regenerated data. The issue also suggests reducing the dataset size, but leaves that choice open.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

The example results files in https://github.com/OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks/pull/350 are generated with older visions of openfe on alchemiscale making extracting the names and phases for the analysis is awkward.

We should generate them again with a new version of openfe and update the exaample. We could also consider reducing the size of the dataset to help with long-term maintainability.

Ngôn ngữ chính
Jupyter Notebook
Star
70
Fork
15
Merge trung bình
5 ngày 19 giờ
Pull request đã merge (30 ngày)
14

Chuẩn bị môi trường

Dự án này không cung cấp dev container, Dockerfile hay hướng dẫn đóng góp, nên bạn cần tự thiết lập môi trường: hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks

Tất cả issue của OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks

Issue tương tự

Thêm issue về Documentation

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.