vanvalenlab/cellSAM

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• Unable ro login to deepcell login

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  vanvalenlab/cellSAM#135 · 2026年9月15日 创建

• Unable to access CellSAM v1.2 weights due to DeepCell account registration/login issue

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  vanvalenlab/cellSAM#134 · 1 条评论 · 2026年8月16日 创建

• Unable to receive activation/password reset email from users.deepcell.org

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  vanvalenlab/cellSAM#133 · 2 条评论 · 2026年7月22日 创建

• Deepcell Registration Issue

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  vanvalenlab/cellSAM#132 · 2026年6月10日 创建

• register via the DeepCell porta

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  vanvalenlab/cellSAM#127 · 1 条评论 · 2026年5月5日 创建

• Unable to access users.deepcell.org and online demo; request for official CellSAM model access for academic research

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  vanvalenlab/cellSAM#125 · 1 条评论 · 2026年4月13日 创建

• I can't log in to the website https://users.deepcell.org/login/ with my email, and I can't download the pretrained model

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  vanvalenlab/cellSAM#124 · 2026年4月12日 创建

• I have completed the registration successfully, but I did not receive the verification email.

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  vanvalenlab/cellSAM#123 · 2026年3月26日 创建

• Unable to receive verification email after successful registration with `.edu.cn` address, and login always says username/password do not match

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  vanvalenlab/cellSAM#122 · 2026年3月15日 创建

• Registration request pending for 40+ days

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  vanvalenlab/cellSAM#121 · 2026年3月9日 创建

• Expanded TissueNet is Undocumented

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  vanvalenlab/cellSAM#120 · 2026年3月7日 创建

• Can't use cellSam because there's no way to get DEEPCELL_ACCESS_TOKEN

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  vanvalenlab/cellSAM#118 · 6 条评论 · 1 个 reaction · 2026年3月4日 创建

• Pre-trained model weights

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  vanvalenlab/cellSAM#116 · 4 条评论 · 2026年1月24日 创建

• Online CellSAM demo fails on official sample image

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  vanvalenlab/cellSAM#115 · 3 条评论 · 2026年1月20日 创建

• Stitching Causes Chopped Off Cells

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  vanvalenlab/cellSAM#113 · 2026年1月14日 创建

• iou_threshold Not Documented Below Function Prototype

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  vanvalenlab/cellSAM#112 · 2026年1月14日 创建

• Download Training Data Output Directory and Archive Size

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  vanvalenlab/cellSAM#111 · 2026年1月5日 创建

• CellSAM Boundaries are Much Bigger than the Cells

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  vanvalenlab/cellSAM#104 · 2025年11月13日 创建

• 2D labels contain nested instances (cell fully inside another)

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  vanvalenlab/cellSAM#103 · 2 条评论 · 2025年10月16日 创建

• Multi GPU support

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  vanvalenlab/cellSAM#102 · 1 条评论 · 2025年10月15日 创建

• Pre-trained model weights - official release, version 1.2

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  Models and Datasets

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  vanvalenlab/cellSAM#90 · 28 条评论 · 2 个 reaction · 2025年9月12日 创建

• Deployment at cellsam.deepcell.org transition to new infrastructure

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  vanvalenlab/cellSAM#75 · 1 条评论 · 2025年7月29日 创建

• Is This Preprocessing Pipeline Suitable for H&E-Stained RGB Input?

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  vanvalenlab/cellSAM#74 · 9 条评论 · 2025年7月21日 创建

• Apply segmentation to H&E images

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  vanvalenlab/cellSAM#63 · 1 条评论 · 2025年4月10日 创建

• Exporting to ONNX possible?

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  vanvalenlab/cellSAM#62 · 2025年4月2日 创建

• Wholeslide segmentation performance issues

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  vanvalenlab/cellSAM#52 · 2025年3月17日 创建

• Ensure output labels are sequential

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  vanvalenlab/cellSAM#42 · 2025年2月21日 创建

• Single channel uint8 input fails with `low_contrast_enhancement=True`

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  vanvalenlab/cellSAM#33 · 1 条评论 · 2025年2月13日 创建

• `cellsam_pipeline` interface

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  vanvalenlab/cellSAM#31 · 1 个 reaction · 2025年2月13日 创建

• Numpy version issue

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  vanvalenlab/cellSAM#25 · 1 条评论 · 2024年9月25日 创建

• Model fine-tuning script

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  vanvalenlab/cellSAM#24 · 6 个 reaction · 2024年9月18日 创建

• CellFinder training

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  vanvalenlab/cellSAM#23 · 2 个 reaction · 2024年9月11日 创建

• Color flag in label layer creation in widget initiation for napari plugin is deprecated

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  vanvalenlab/cellSAM#22 · 2 个 reaction · 2024年7月16日 创建

• Error 'numpy.ndarray' object has no attribute 'unsqueeze' when passing bounding boxes into segment_cellular_image

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  vanvalenlab/cellSAM#21 · 1 个 reaction · 2024年7月15日 创建

• Bounding box prediction using other backbones

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  vanvalenlab/cellSAM#20 · 1 条评论 · 2024年6月19日 创建

• How to convert ground truth cell masks into bounding boxes

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  vanvalenlab/cellSAM#19 · 1 条评论 · 2024年6月6日 创建

• Model training script of CellSAM

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  vanvalenlab/cellSAM#18 · 3 条评论 · 2024年4月13日 创建

• Discussion: mask dtype

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  vanvalenlab/cellSAM#16 · 2024年4月9日 创建

• `segment_cellular_images` should always return the same output type

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  vanvalenlab/cellSAM#13 · 1 个 reaction · 2024年4月3日 创建

• Package name

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  vanvalenlab/cellSAM#10 · 2024年3月30日 创建

• napari plugin?

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  vanvalenlab/cellSAM#5 · 2 条评论 · 1 个 reaction · 2024年3月29日 创建

• Most pre-processing functions and process_and_segment_image expect 3 dimensions, but percentile_threshold seems to expect 4

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  vanvalenlab/cellSAM#3 · 1 个 reaction · 2024年3月25日 创建

• Add option to pass bounding boxes to process_and_segment_image

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  vanvalenlab/cellSAM#2 · 1 个 reaction · 2024年3月25日 创建