Memory leak when calling certain python packages from Julia via PythonCall
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评估
- 难度
- 4/5
- 预计耗时
- 3-5 天
- 新手友好度
- 45/100
- Issue 类型
- 缺陷
- 描述清晰度
- 基本清楚
- 活跃度
- 冷清
- 领域
- performance
调研方向
首先，使用列出的 Julia、Python 和 package 版本运行所提供的 PythonCall 和 matplotlib MWE，然后将其内存行为与 numpy 循环进行比较。调查为何关闭并删除 figure 和 axes 后内存仍未释放；当重复循环不再无限增长，并且已在 REPL 和命令行脚本中验证该行为时，即视为完成。
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
Affects: PythonCall
Describe the bug
Memory is not released when repeatedly creating and closing matplotlib figures via PythonCall. I originally had the issue with an elaborate cartopy plotting loop, but have managed to recreate it in a simple while true loop MWE. Each iteration allocates a new figure/axes via plt.subplots, immediately closes it with plt.close, calls PythonCall.pydel! on both the figure and axes objects, and calls GC.gc(). However, there is still a leak until the process is killed.
This does not occur when repeatedly allocating and deleting a numpy array in an equivalent loop, so the issue has something to do with what kind of python objects are created. I also have similar memory leak issues with scikit-learn.
The issue is reproducable both in the Julia REPL and in the VS Code Julia extension, and when I execute a script containing the below code from the command line.
MWE:
using PythonCall
@py import matplotlib.pyplot as plt
i = 0
while true
global i += 1
fig, ax = plt.subplots(1, 1)
plt.close(fig)
PythonCall.pydel!(ax)
PythonCall.pydel!(fig)
GC.gc()
println("Iteration $i done")
end
My system
OS: macOS 15.7.4 (arm64, Apple Silicon)
Julia: 1.12.6
Python: 3.14.2 (conda-forge, Clang 20.1.8)
PythonCall: 0.9.31
matplotlib: 3.10.8
Thanks for your help!
- 主要语言
- Julia
- 星标
- 1.1k
- 派生
- 89
- 平均合并
- 23 小时 52 分钟
- 30 天内合并 PR
- 4
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