Memory leak when calling certain python packages from Julia via PythonCall
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評估
- 難度
- 4/5
- 預估耗時
- 3-5 天
- 新手友好度
- 45/100
- Issue 類型
- 缺陷
- 描述清晰度
- 基本清楚
- 活躍度
- 冷清
- 領域
- performance
研究方向
先使用列出的 Julia、Python 和 package 版本執行提供的 PythonCall 與 matplotlib MWE，然後將其記憶體行為與 numpy 迴圈進行比較。調查為何關閉並刪除 figure 和 axes 後記憶體仍未釋放；當重複迴圈不再無限增長，且已在 REPL 和命令列腳本中驗證該行為時，即視為完成。
由索引模型根據 Issue 內容生成。
描述
Affects: PythonCall
Describe the bug
Memory is not released when repeatedly creating and closing matplotlib figures via PythonCall. I originally had the issue with an elaborate cartopy plotting loop, but have managed to recreate it in a simple while true loop MWE. Each iteration allocates a new figure/axes via plt.subplots, immediately closes it with plt.close, calls PythonCall.pydel! on both the figure and axes objects, and calls GC.gc(). However, there is still a leak until the process is killed.
This does not occur when repeatedly allocating and deleting a numpy array in an equivalent loop, so the issue has something to do with what kind of python objects are created. I also have similar memory leak issues with scikit-learn.
The issue is reproducable both in the Julia REPL and in the VS Code Julia extension, and when I execute a script containing the below code from the command line.
MWE:
using PythonCall
@py import matplotlib.pyplot as plt
i = 0
while true
global i += 1
fig, ax = plt.subplots(1, 1)
plt.close(fig)
PythonCall.pydel!(ax)
PythonCall.pydel!(fig)
GC.gc()
println("Iteration $i done")
end
My system
OS: macOS 15.7.4 (arm64, Apple Silicon)
Julia: 1.12.6
Python: 3.14.2 (conda-forge, Clang 20.1.8)
PythonCall: 0.9.31
matplotlib: 3.10.8
Thanks for your help!
- 主要語言
- Julia
- 星號
- 1.1k
- 分支
- 88
- 平均合併
- 3 天 2 小時
- 30 天內合併 PR
- 6
環境準備
這個專案沒有提供開發容器、Dockerfile 或貢獻指南，環境需要你自己搭建：先看它的 README，通用步驟見我們的新手貢獻指南。
從這裡開始
- 先讀完整個 Issue，再讀專案的貢獻指南。
- 在 Issue 下留言說明你要接手 —— 這能避免兩個人做同樣的事。
- Fork 儲存庫，在一個分支上完成修改。
- 送出 Pull Request，並在描述裡引用這個 Issue 編號。
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