Populate ome context
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評估
研究方向
先閱讀 bidsschematools.types.protocols.Ome 協定以及相關的 bidsschematools.types.context 文件。評估 ome-zarr-py 對 .ome.zarr 檔案的支援，以及 ome-types 對 .ome.tif/.ome.btf 檔案的支援，重點放在快速存取中繼資料，而不是陣列存取。當列出的每個後綴都能填入一個符合 Ome 協定的物件時，即表示完成。
由索引模型根據 Issue 內容生成。
描述
If a file suffix is .ome.tif or .ome.btf or .ome.zarr, it should populate the ome context.
The object needs to follow the protocol bidsschematools.types.protocols.Ome, possibly just using bidsschematools.types.context.Gzip.
For .ome.zarr files, https://github.com/ome/ome-zarr-py is probably the right tool for the job. For .ome.tif/.ome.btf, I think https://github.com/tlambert03/ome-types looks like the right thing. The OME group discussed deprecating their own Python bindings for this project in https://github.com/ome/ome-model/issues/194. It seems like there isn't a lack of options: https://pypi.org/search/?q=ome
Note that our concern is fast metadata access, not data array access.
- 主要語言
- Python
- 星號
- 10
- 分支
- 7
- PR 合併指標
- 30 天內沒有已合併 PR
環境準備
- 沒有 Dockerfile 或 Docker Compose 檔案
- 沒有 Pull Request 範本
- 閱讀貢獻指南
從這裡開始
- 先讀完整個 Issue，再讀專案的貢獻指南。
- 在 Issue 下留言說明你要接手 —— 這能避免兩個人做同樣的事。
- Fork 儲存庫，在一個分支上完成修改。
- 送出 Pull Request，並在描述裡引用這個 Issue 編號。
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