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AllenCell
已索引 21 個儲存庫 · 在 GitHub 檢視
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vole-core
core rendering canvas and data loading services for Vol-E volume viewer
TypeScript · 107 個 star
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agave
High quality visualization for volumetric image data
C++ · 63 個 star
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Python · 32 個 star
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Python · 32 個 star
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aics-segmentation
Part 1 of Allen Cell and Structure Segmenter: classic image segmentation workflow
Jupyter Notebook · 26 個 star
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cvapipe_analysis
Analysis of data produced by cvapipe for the variance paper
Jupyter Notebook · 24 個 star
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Python · 24 個 star
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napari-allencell-segmenter
A plugin that enables image segmentation provided by Allen Institute for Cell Science
Python · 21 個 star
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segmenter_model_zoo
scripts and API for running Deep Learning models from segmenter
Jupyter Notebook · 10 個 star
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Python · 7 個 star
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benchmarking_representations
Benchmarking different methods for extracting unsupervised representations from images
Python · 7 個 star
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allencell-segmenter-ml
Napari plugin for ml segmentation
Python · 5 個 star
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tfe-data
example scripts and utilities for preparing data for the time series colorizer app
Python · 4 個 star
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endothelial-pipeline
Dynamics of ML-based morphological features indicate a shear stress-dependent bifurcation of hiPSC-derived endothelial cell states
Python · 2 個 star
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cell-feature-explorer
Plot and explore data that is linked to images, with an embedded viewer
TypeScript · 2 個 star
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EMT_data_analysis
This repo contains code for EMT deliverable data analysis and has dependencies associated with output from EMT_image_analysis repo.
Python · 1 個 star
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Python · 0 個 star
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camera-alignment-core
Core algorithms for alignment of two-camera microscopy imagery
Python · 0 個 star
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cellpack-client
Frontend interface for cellPACK
TypeScript · 0 個 star
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cell-catalog
Cell catalog 2.0
TypeScript · 0 個 star
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可能已有人在做的 issue 排在最後。 全部依時間排序
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ux
難度 4/5 3-5 天 新手友好度 48/100
維護者通常 2 天內回覆
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enhancement question
難度 5/5 一週以上 新手友好度 35/100
AllenCell/vole-core#483 · 2 則留言 ·
維護者通常 2 天內回覆
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use zenodo API未關閉
難度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100
AllenCell/idea-board#141 ·
維護者通常 8 天內回覆
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EPIC: Contact未關閉
難度 5/5 一週以上 新手友好度 25/100
AllenCell/idea-board#135 ·
維護者通常 8 天內回覆
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Public API to add an idea via a backend service可能重新可做 @interim17 於 38 天前認領，目前沒有進行中的 PR。 未關閉
難度 5/5 一週以上 新手友好度 20/100
AllenCell/idea-board#123 · 已指派 1 人 ·
維護者通常 8 天內回覆
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Redesign to have "how to start working on this"可能重新可做 @interim17 於 38 天前認領，目前沒有進行中的 PR。 未關閉
難度 5/5 一週以上 新手友好度 30/100
AllenCell/idea-board#122 · 已指派 1 人 ·
維護者通常 8 天內回覆
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Add fields to idea data model可能重新可做 @interim17 於 38 天前認領，目前沒有進行中的 PR。 未關閉
難度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100
AllenCell/idea-board#121 · 已指派 1 人 ·
維護者通常 8 天內回覆
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new resource types可能重新可做 @interim17 於 38 天前認領，目前沒有進行中的 PR。 未關閉
難度 5/5 一週以上 新手友好度 30/100
AllenCell/idea-board#119 · 已指派 1 人 ·
維護者通常 8 天內回覆
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enhancement
難度 5/5 一週以上 新手友好度 25/100
維護者通常 2 天內回覆
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internals new feature
難度 5/5 一週以上 新手友好度 35/100
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test未關閉bug
難度 5/5 一週以上 新手友好度 10/100
AllenCell/idea-board#117 ·
維護者通常 8 天內回覆
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bug
難度 2/5 1-3 小時 新手友好度 72/100
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enhancement
難度 3/5 1-2 天 新手友好度 55/100
AllenCell/cell-feature-explorer#299 · 1 個 reaction ·
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難度 3/5 1-2 天 新手友好度 48/100
AllenCell/endothelial-pipeline#1827 ·
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CMS publishes all PRs under Megan's name可能重新可做 @interim17 於 80 天前認領，目前沒有進行中的 PR。 未關閉bug
難度 3/5 1-2 天 新手友好度 48/100
AllenCell/idea-board#110 · 2 則留言 · 已指派 1 人 ·
維護者通常 8 天內回覆
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bug
難度 4/5 3-5 天 新手友好度 52/100
維護者通常 15 天內回覆
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難度 5/5 一週以上 新手友好度 35/100
維護者通常 15 天內回覆
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難度 5/5 一週以上 新手友好度 45/100
維護者通常 15 天內回覆
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Feature request: expose mesh-based API (get_shcoeffs_from_mesh / get_shcoeffs_from_vertices_faces)未關閉
難度 5/5 一週以上 新手友好度 35/100
AllenCell/aics-shparam#23 · 1 則留言 ·
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Set of dependencies/files to keep/delete可能重新可做 @vianamp 於 124 天前認領，目前沒有進行中的 PR。 未關閉
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難度 5/5 一週以上 新手友好度 35/100
AllenCell/endothelial-pipeline#1645 · 3 則留言 ·
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難度 3/5 1-2 天 新手友好度 55/100
維護者通常 15 天內回覆
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難度 5/5 一週以上 新手友好度 35/100
維護者通常 15 天內回覆
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難度 3/5 1-2 天 新手友好度 55/100
維護者通常 15 天內回覆
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bug
難度 4/5 3-5 天 新手友好度 20/100
維護者通常 15 天內回覆
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難度 2/5 1-3 小時 新手友好度 68/100
維護者通常 15 天內回覆
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難度 4/5 3-5 天 新手友好度 42/100
維護者通常 15 天內回覆
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Single JSON collection for contact list可能重新可做 @interim17 於 151 天前認領，目前沒有進行中的 PR。 未關閉
AllenCell/idea-board#97 · 已指派 1 人 ·
維護者通常 8 天內回覆
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Tech Debt
難度 4/5 3-5 天 新手友好度 55/100
維護者通常 2 天內回覆
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Tech Debt
難度 5/5 一週以上 新手友好度 42/100
AllenCell/vole-core#413 · 1 則留言 ·
維護者通常 2 天內回覆
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Tech Debt
難度 4/5 3-5 天 新手友好度 52/100
維護者通常 2 天內回覆
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Tech Debt
難度 5/5 一週以上 新手友好度 35/100
維護者通常 2 天內回覆
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Tech Debt
難度 2/5 1-3 小時 新手友好度 68/100
維護者通常 2 天內回覆
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Tech Debt
難度 5/5 一週以上 新手友好度 25/100
維護者通常 2 天內回覆
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Tech Debt
難度 4/5 3-5 天 新手友好度 48/100
AllenCell/vole-core#404 · 1 則留言 ·
維護者通常 2 天內回覆
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難度 5/5 一週以上 新手友好度 25/100
維護者通常 2 天內回覆
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Race condition in `promote.yml` causes deploys to be skipped可能重新可做 @ShrimpCryptid 於 179 天前認領，目前沒有進行中的 PR。 未關閉bug Tech debt
AllenCell/cell-feature-explorer#281 · 已指派 1 人 ·
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enhancement
難度 5/5 一週以上 新手友好度 30/100
AllenCell/cell-feature-explorer#277 · 1 則留言 ·
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enhancement
難度 4/5 3-5 天 新手友好度 48/100
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Annotation tools未關閉enhancement question
難度 5/5 一週以上 新手友好度 25/100
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enhancement
難度 4/5 3-5 天 新手友好度 48/100
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bug
難度 3/5 1-2 天 新手友好度 55/100
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難度 3/5 1-2 天 新手友好度 65/100
AllenCell/cell-feature-explorer#268 · 1 個 reaction ·
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bug Tech Debt
難度 4/5 3-5 天 新手友好度 45/100
AllenCell/vole-core#383 · 1 則留言 ·
維護者通常 2 天內回覆
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milestone candidate
難度 5/5 一週以上 新手友好度 45/100
AllenCell/vole-core#381 · 3 則留言 · 1 個 reaction ·
維護者通常 2 天內回覆
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Size measurement未關閉ux
難度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100
AllenCell/vole-core#380 · 1 則留言 ·
維護者通常 2 天內回覆
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Error when calculating feature min/max可能重新可做 @ShrimpCryptid 於 193 天前認領，目前沒有進行中的 PR。 未關閉bug
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難度 4/5 3-5 天 新手友好度 42/100
維護者通常 15 天內回覆
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bug
難度 5/5 一週以上 新手友好度 25/100
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UX
難度 3/5 1-2 天 新手友好度 35/100
維護者通常 15 天內回覆
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