storing superchain_ids for rhat_nested

Đang mở
#450 3 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
5/5
Thời gian dự kiến
Hơn một tuần
Mức phù hợp với người mới
35/100
Loại issue
Tính năng
Độ rõ ràng
Cần làm rõ
Mức độ hoạt động
Ít trao đổi
Công nghệ
r
Lĩnh vực
data

Hướng nghiên cứu

Bắt đầu bằng cách đọc rhat_nested và summarise_draws để hiểu superchain_ids hiện đang được truyền như thế nào. Issue này cần quyết định có thêm một hàm add_superchain_ids hay không, có lưu các giá trị dưới dạng một thuộc tính hay không, và có để summarise_draws tự động sử dụng chúng hay không. Được xem là hoàn tất khi API và hành vi tự động đã được thống nhất và triển khai nhất quán.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

I have been working a bit with many short chains, and using nested R-hat as a convergence diagnostic. rhat_nested has an additional argument superchain_ids which is a vector specifying which superchain each chain belongs to. My current workflow is to add the superchain_ids as an attribute to a posterior::draws object, and then do something like

summarise_draws(draws, rhat_nested = ~rhat_nested(.x, superchain_ids = attr(draws, "superchain_ids"))

This is a bit cumbersome, and maybe it could be improved with:

  • a new function add_superchain_ids, which will then add the superchain_ids to the draws object (as an attribute?)
  • have summarise_draws automatically use the stored superchain_ids for rhat_nested

Any thoughts on this? I could make a PR if this seems reasonable

Ngôn ngữ chính
R
Star
172
Fork
27
Merge trung bình
5 ngày 12 giờ
Pull request đã merge (30 ngày)
5

Chuẩn bị môi trường

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của stan-dev/posterior

Tất cả issue của stan-dev/posterior

Issue tương tự

Thêm issue về R

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.