Notebook on 3D data and on images from multiple imaging cycles
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 4/5
- Thời gian dự kiến
- 3-5 ngày
- Mức phù hợp với người mới
- 35/100
- Loại issue
- Tài liệu
- Độ rõ ràng
- Khá rõ ràng
- Mức độ hoạt động
- Đình trệ
- Công nghệ
- jupyter-notebook, numpy
- Lĩnh vực
- computer-vision, data-visualization, documentation
Hướng nghiên cứu
Trước tiên, hãy xem xét việc refactoring các phép biến đổi mới và notebook stitch đã được merge. Xây dựng một notebook bao quát các lát cắt 2D hoặc phép chiếu cực đại từ các ảnh 3D lớn, việc xếp chồng ảnh từ nhiều chu kỳ với xoay, rasterize lại và crop, cũng như việc trực quan hóa các lớp 2D trong 3D bằng napari. Được xem là hoàn thành khi cả hai workflow liên quan được minh họa cùng nhau.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
Two related concepts that would be nice to show, and show in the same notebook (from a discussion with @lopollar and @melonora).
Sometimes the user has a large 3D image and wants to operate on a 2D slice (or use a 2D max projection), and sometime the users have many two images and want to stack them together in a 3D image, or in a 2D multichannel image (the stacking is not just a "numpy array stacking", but it could involve rotations, etc and requires re-rasterization and cropping).
After the new transformations refactoring and the merge of the stitch notebook this will be supported and it would be nice to show this to the user, together with a napari viz of the 2D layers embedded in the 3D space.
- Ngôn ngữ chính
- Jupyter Notebook
- Star
- 67
- Fork
- 26
- Merge trung bình
- 4 phút
- Pull request đã merge (30 ngày)
- 1
Hướng dẫn đóng góp
Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của scverse/spatialdata-tutorials
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 45/100
scverse/spatialdata-tutorials#150 · 1 bình luận ·
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 55/100
scverse/spatialdata-tutorials#146 · 1 reaction ·
-
Intro notebook not in docs Đang mở
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100
scverse/spatialdata-tutorials#137 ·
-
Update Xenium dataset Đang mở
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
scverse/spatialdata-tutorials#110 ·
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 30/100
scverse/spatialdata-tutorials#106 ·
Tất cả issue của scverse/spatialdata-tutorials
Issue tương tự
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 70/100
open-compass/VLMEvalKit#1705 ·
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 65/100
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100
-
BUG
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 84/100
babalae/better-genshin-impact#3703 · 3 bình luận ·
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 88/100
flatironinstitute/CaImAn#1586 ·