Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

cytomining/CytoTable

Đăng nhập để theo dõi Xem trên GitHub

Harmonize high-content image analysis tool outputs for processing with Pycytominer and other Cytomining tools.

cytomining/CytoTable có thân thiện với người mới không?

Gần đây có quá ít pull request của người đóng góp bên ngoài gửi tới cytomining/CytoTable để nói chúng được merge thường xuyên đến đâu. Hiện chưa có issue nào phù hợp với người mới đang mở; danh sách bên dưới là các issue khác chúng tôi có của kho này.

Star
21
Fork
6
Issue cho người mới đang mở
0
Issue đã lập chỉ mục
81
Merge trung bình
14 giờ 9 phút
Pull request đã merge (30 ngày)
6
Ngôn ngữ chính
Python
Giấy phép
BSD-3-Clause
Lần push lên GitHub gần nhất
21/9/2026
Lập chỉ mục gần nhất
15/9/2026
Hướng dẫn đóng góp
Quy tắc ứng xử
Label cho người mới
Chưa lập chỉ mục label nào cho người mới

Cách đóng góp cho cytomining/CytoTable

  1. Hãy đọc hướng dẫn đóng góp trước: nó cho biết maintainer muốn thay đổi được đề xuất, kiểm thử và review ra sao.
  2. Hãy đọc quy tắc ứng xử: nó áp dụng cho issue và pull request cũng như trò chuyện.
  3. Đóng góp của bạn sẽ được phát hành theo giấy phép BSD-3-Clause của dự án.
  4. Theo dõi kho này để biết khi có issue mới phù hợp với người mới, hoặc xem các issue khác bên dưới.
Phù hợp cho người mới Tất cả
Đang mở Tất cả

Các issue có thể đã có người làm được xếp cuối danh sách. Sắp xếp tất cả theo ngày

  • Enable remote SQLite references
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100

    cytomining/CytoTable#485 ·

  • NameError: Cytotable not defined
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    cytomining/CytoTable#476 · 3 bình luận ·

  • Find a way for users to avoid SQL configurations
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 55/100

    cytomining/CytoTable#454 · 1 bình luận ·

  • Question: Best practices to limit CPU usage?
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100

    cytomining/CytoTable#437 · 5 bình luận · 1 reaction ·

  • Refactor `convert.py` with greater modularity
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    cytomining/CytoTable#430 ·

  • Image features and important Metadata fields missing from parquets
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    question

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    cytomining/CytoTable#425 · 5 bình luận ·

  • Check for empty or zero row tables (provide specific warning)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100

    cytomining/CytoTable#409 ·

  • Fail to summarize across plate
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    cytomining/CytoTable#377 · 3 bình luận · 1 reaction ·

  • Can't run examplehuman
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    question

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    cytomining/CytoTable#374 · 7 bình luận ·

  • Consider use of `pyarrow.lib.RecordBatchReader` for internal streamable data handling
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    cytomining/CytoTable#371 ·

  • Using compartments to input CSVs with custom names
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    question

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100

    cytomining/CytoTable#362 · 6 bình luận ·

  • New CytoTable preset?
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    cytomining/CytoTable#358 · 2 bình luận · 1 người được giao ·

  • Add anndata input capabilities
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    cytomining/CytoTable#347 ·

  • Error when a cell-nucleus pair does not exists: IndexError: list index out of range
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug enhancement

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    cytomining/CytoTable#339 · 1 bình luận · 1 reaction ·

  • Add code coverage details to readme
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    documentation

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 35/100

    cytomining/CytoTable#336 ·

  • Cleanup `parsl` logging directory and make unique by default for concurrent usage
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    cytomining/CytoTable#330 · 3 bình luận ·

  • Migrate from `mypy` to `ty` for type linting
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    cytomining/CytoTable#329 ·

  • Add DuckDB as a data source
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 38/100

    cytomining/CytoTable#319 ·

  • Add Parquet as a data source
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100

    cytomining/CytoTable#318 ·

  • Add command-line interface (CLI)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 20/100

    cytomining/CytoTable#316 ·

  • Add PathName as default to extract for CytoTable
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 42/100

    cytomining/CytoTable#305 · 1 reaction ·

  • How do we determine what CellProfiler `features` are `metadata` or not?
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    question

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    cytomining/CytoTable#294 · 1 bình luận · 1 reaction ·

  • Add single-cell images to output
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    cytomining/CytoTable#262 ·

  • Add Lance output option
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 30/100

    cytomining/CytoTable#261 ·

  • Installation may hang for long periods during dependency resolutions for `boto3` or `botocore`
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    cytomining/CytoTable#224 ·

  • Reduce join operation memory consumption
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    cytomining/CytoTable#223 ·

  • Make root cause exceptions more visible through customized handling and/or logging
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    cytomining/CytoTable#222 ·

  • Issue Running in Jupyter Notebook for convert_parquet Function
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    question

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100

    cytomining/CytoTable#221 · 1 bình luận · 1 reaction ·

  • Update `CITATION.cff` with contributors
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 25/100

    cytomining/CytoTable#219 ·

  • Set temporary cache locations of dependencies from one location
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    cytomining/CytoTable#218 ·

  • Add timeout for large directory parsing in source processing
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    cytomining/CytoTable#209 ·

  • Extract or somehow store data from CellProfiler `experiment` tables in CytoTable output
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 30/100

    cytomining/CytoTable#203 ·

  • Retain extracted, unjoined table output when joining data in CytoTable
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    cytomining/CytoTable#202 ·

  • Define ideal compartment and metadata table relationships for joins to avoid returning NA results
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    cytomining/CytoTable#201 ·

  • Provide data statistics report as part of CytoTable output
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    cytomining/CytoTable#200 · 1 bình luận ·

  • Enable `_concat_source_group` single file pass-through to avoid rewrites
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 55/100

    cytomining/CytoTable#191 ·

  • Add capability to sample source datasets by percent or rowcount to increase speed of testing
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    cytomining/CytoTable#190 · 1 bình luận ·

  • Consistently handle `Metadata_Well` and `Metadata_Plate` column renaming and join specification
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    cytomining/CytoTable#189 ·

  • Verify how large floating-point numbers are exported
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?
    question

    cytomining/CytoTable#187 · 3 bình luận · 1 người được giao ·

  • Add SBOM file to repository
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100

    cytomining/CytoTable#185 ·

  • Use OpenLineage API (or other similar tooling) as basis for CytoTable Paquet metadata output
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    cytomining/CytoTable#180 ·

  • Document Parsl SlurmProvider usage for CU Alpine HPC
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    documentation enhancement

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    cytomining/CytoTable#179 ·

  • Explore pyarrow parquet write_dataset
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 20/100

    cytomining/CytoTable#177 ·

  • Outline the best settings for Parsl configuration with CytoTable
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    cytomining/CytoTable#176 · 7 bình luận · 1 người được giao ·

  • `WorkerLost: Task failure due to loss of worker` Failure during join data creation using HTE Parsl config with `SQ00014613.sqlite`
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 30/100

    cytomining/CytoTable#169 ·

  • Address IN Carta data output when `concat=False`
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100

    cytomining/CytoTable#154 ·

  • Simplify data output to single directory or filepath
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 32/100

    cytomining/CytoTable#150 ·

  • Add data source filenames and directories to CytoTable metadata (or similar)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 20/100

    cytomining/CytoTable#149 ·

  • `parsl.jobs.errors.TooManyJobFailuresError` sporadically occurs on MacOS Images for GitHub Actions jobs during `pytest` operations
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 30/100

    cytomining/CytoTable#143 · 2 bình luận ·

  • Enable automatic `local_cache_dir` specification for cloud-based SQLite data sources
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    cytomining/CytoTable#140 ·

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.