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Summation of ConstantArray of 0 with vector of 0's fails

Aberta
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Avaliação

Dificuldade
3/5
Tempo estimado
1-2 dias
Facilidade para iniciantes
45/100
Tipo de issue
Bug
Clareza
Razoavelmente clara
Status de atividade
Estagnada
Stack de tecnologia
r
Domínio
data

Direção de pesquisa

Reproduza o caso de valor zero começando com DelayedArray::ConstantArray e o ponto de entrada HDF5Array::writeHDF5Array; em seguida, compare-o com as combinações funcionais mostradas no relatório. Considera-se concluído quando o ConstantArray de zeros e o vetor de zeros puderem ser gravados com sucesso, com os exemplos existentes servindo como verificações de regressão.

Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.

Descrição

Hi,

I ran into a curious edge case, where summing a ConstantArray with a vector fails if both are zero and then writing it with HDF5Array::writeHDF5Array, but not in any other combination:

mat <- DelayedArray::ConstantArray(c(2, 4), value = 0)
res <- mat + rep(0, 2)
res
#> <2 x 4> sparse DelayedMatrix object of type "double":
#>      [,1] [,2] [,3] [,4]
#> [1,]    0    0    0    0
#> [2,]    0    0    0    0
HDF5Array::writeHDF5Array(res)
#> Error in .Arith_SVT1_v2(.Generic, e1, e2): "+" is not supported between a SparseArray object and a numeric vector
#>   (result wouldn't be sparse in general)

# All other combination seems to work
mat <- DelayedArray::ConstantArray(c(2, 4), value = 0)
res <- mat + rep(3, 2)
HDF5Array::writeHDF5Array(res)
#> <2 x 4> HDF5Matrix object of type "double":
#>      [,1] [,2] [,3] [,4]
#> [1,]    3    3    3    3
#> [2,]    3    3    3    3

mat <- DelayedArray::ConstantArray(c(2, 4), value = 17)
res <- mat + rep(0, 2)
HDF5Array::writeHDF5Array(res)
#> <2 x 4> HDF5Matrix object of type "double":
#>      [,1] [,2] [,3] [,4]
#> [1,]   17   17   17   17
#> [2,]   17   17   17   17

mat <- DelayedArray::ConstantArray(c(2, 4), value = 0)
res <- mat + 0
HDF5Array::writeHDF5Array(res)
#> <2 x 4> sparse HDF5Matrix object of type "double":
#>      [,1] [,2] [,3] [,4]
#> [1,]    0    0    0    0
#> [2,]    0    0    0    0

Created on 2025-03-05 with reprex v2.1.1

I am not actually 100% this is an DelayedArray issue or if it might rather need to be moved to HDF5Array.

Best,
Constantin

Linguagem predominante
R
Estrelas
29
Forks
12
Nenhum PR com merge em 30d

Guia de contribuição

Nenhum guia de contribuição indexado para este repositório

Primeiros passos

  1. Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
  2. Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
  3. Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
  4. Abra um pull request que referencie o número da issue.

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