scverse/rustar-aligner
A rust implementation of STAR
scverse/rustar-aligner は初心者に優しい？
直近 30 日間に、scverse/rustar-aligner は外部コントリビューターの PR 10 件のうち 0 件をマージしました。 初心者向けの issue が現在 2 件オープンです。
- スター
- 76
- フォーク
- 7
- オープンの初心者向け issue
- 2
- 索引済み issue
- 39
- 主要言語
- Rust
- ライセンス
- MIT
- 最終 GitHub push
- 2026年8月27日
- 最新の索引
- 2026年9月19日
- コントリビューションガイド
- コントリビューションガイド
- 行動規範
- 行動規範
- 初心者向けラベル
- 初心者向けラベルは索引されていません
- PR マージ指標
- 30日以内にマージされた PR はありません
scverse/rustar-aligner にコントリビュートするには
- まずコントリビューションガイドを読みましょう。変更の提案、テスト、レビューの進め方が書かれています。
- Dockerfile または Docker Compose ファイルがあるので、ツールチェーン一式を入れなくても動かせます。
- 行動規範も読んでおきましょう。チャットだけでなく issue や PR にも適用されます。
- 下にある 2 件の初心者向けのオープンな issue から 1 つ選び、作業を始める前に取り組みたいとコメントしましょう。
誰かが対応中かもしれないイシューは最後に並べています。 すべて日付順に表示
-
難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 10/100
scverse/rustar-aligner#277 ·
-
Enable performance (here speed) benchmarking再び着手できるかも @flying-sheep が 40 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン
scverse/rustar-aligner#245 · 担当者 1 名 ·
-
Enable middle/larger scale dataset tests再び着手できるかも @Zethson が 40 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン
scverse/rustar-aligner#244 · 担当者 1 名 ·
-
dependencies
難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100
scverse/rustar-aligner#208 ·
-
--limitBAMsortRAM aborts instead of spilling: evaluate an external sort for coordinate-sorted BAMオープンenhancement
難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 45/100
scverse/rustar-aligner#206 · コメント 1 件 ·
-
Dependency discussion: portable SIMD crate (wide/pulp) vs the hand-rolled intrinsics in simd_scan.rsオープンdependencies
難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100
scverse/rustar-aligner#205 ·
-
dependencies
難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 48/100
scverse/rustar-aligner#203 ·
-
dependencies
難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 30/100
scverse/rustar-aligner#202 ·
-
dependencies
難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 30/100
scverse/rustar-aligner#201 ·
-
難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100
scverse/rustar-aligner#195 · コメント 1 件 ·
-
難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100
scverse/rustar-aligner#181 ·
-
難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100
scverse/rustar-aligner#163 · コメント 1 件 ·
-
dependencies
難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 30/100
scverse/rustar-aligner#162 ·
-
難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 10/100
scverse/rustar-aligner#143 · コメント 2 件 ·
-
file-formats
難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 45/100
scverse/rustar-aligner#97 ·
-
Output RAD output再び着手できるかも @rob-p が 103 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープンfile-formats
scverse/rustar-aligner#96 · 担当者 1 名 ·
-
Add GPU acceleration再び着手できるかも @rob-p が 103 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープンenhancement
scverse/rustar-aligner#94 · コメント 1 件 · 担当者 2 名 ·
-
Code organization and style再び着手できるかも @flying-sheep が 103 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン
scverse/rustar-aligner#63 · コメント 1 件 · リアクション 2 件 · 担当者 1 名 ·
-
BufferedSamRecords::new() reserves 10,000 records per read対応中かも @BenjaminDEMAILLE が 7 日前に担当しました。 オープン
難易度 1/5 1時間未満 初心者へのやさしさ 88/100
scverse/rustar-aligner#280 ·
-
Single-end --chimOutType WithinBAM fails with "read length-sequence length mismatch"対応中かも このイシューにリンクされたプルリクエストがオープン中、またはマージ済みです。 オープンbug
難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 72/100
scverse/rustar-aligner#279 ·
-
Consider hdf5-pure (pure-Rust HDF5) for optional .h5 output対応中かも このイシューにリンクされたプルリクエストがオープン中、またはマージ済みです。 オープンdependencies file-formats
難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100
scverse/rustar-aligner#270 ·
-
outFilterMismatchNoverLmax is applied to the read length, not the mapped length対応中かも @BenjaminDEMAILLE が 40 日前に担当しました。 オープン
難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 74/100
scverse/rustar-aligner#238 ·
-
solo: --soloBarcodeMate does not require clipping the barcode off the mate, so the barcode bases stay in the aligned read対応中かも @BenjaminDEMAILLE が 41 日前に担当しました。 オープン
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 84/100
scverse/rustar-aligner#227 ·
-
Dependency discussion: optional rapidgzip feature for parallel gzip input対応中かも このイシューにリンクされたプルリクエストがオープン中、またはマージ済みです。 オープンdependencies
難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100
scverse/rustar-aligner#224 · コメント 1 件 ·
-
Align pipeline stops scaling past ~4-8 threads: decode and write are each a single thread対応中かも このイシューにリンクされたプルリクエストがオープン中、またはマージ済みです。 オープンenhancement
難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 42/100
scverse/rustar-aligner#223 · コメント 2 件 ·
-
Read other compressed input formats (bz2 / zstd / xz): evaluate niffler対応中かも @BenjaminDEMAILLE が 7 日前に担当しました。 オープンdependencies
難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100
scverse/rustar-aligner#218 · コメント 1 件 ·
-
GzDecoder truncates multi-member gzip input: reads are silently dropped対応中かも @BenjaminDEMAILLE が 60 日前に担当しました。 オープンbug
難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 76/100
scverse/rustar-aligner#217 ·
-
Audit: does DashMap/HashMap iteration order in the splice-junction path reach any output?対応中かも このイシューにリンクされたプルリクエストがオープン中、またはマージ済みです。 オープンbug
難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 58/100
scverse/rustar-aligner#210 · コメント 1 件 ·
-
docs: add DEPENDENCIES.md recording accepted and declined crates対応中かも @BenjaminDEMAILLE が 40 日前に担当しました。 オープンdocumentation
難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 68/100
scverse/rustar-aligner#209 ·
-
deps: noodles 0.113 -> 0.115 and noodles-bgzf 0.49 -> 0.51 (local thread pools, with_worker_count)対応中かも @BenjaminDEMAILLE が 62 日前に担当しました。 オープンdependencies
難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 42/100
scverse/rustar-aligner#207 ·
-
dev-deps: add a benchmark harness (divan or criterion) — there is no benches/ today対応中かも @BenjaminDEMAILLE が 40 日前に担当しました。 オープンdependencies
難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 55/100
scverse/rustar-aligner#204 ·
-
CellRanger4 + clip5pNbases/clip3pNbases misplaces reads by clip5pNbases対応中かも @BenjaminDEMAILLE が 41 日前に担当しました。 オープンbug
難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 55/100
scverse/rustar-aligner#199 · コメント 2 件 ·
-
New Dependency: hyalite for CR4対応中かも @BenjaminDEMAILLE が 62 日前に担当しました。 オープンdependencies
scverse/rustar-aligner#197 · 担当者 2 名 ·
-
Removal of CLAUDE.md対応中かも @Psy-Fer が 64 日前に担当しました。 オープンdocumentation
scverse/rustar-aligner#196 · コメント 2 件 · リアクション 1 件 · 担当者 1 名 ·
-
solo: two CellRanger-matching flags are inert, and the count matrix is 8.9% off対応中かも このイシューにリンクされたプルリクエストがオープン中、またはマージ済みです。 オープン
難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100
scverse/rustar-aligner#172 · コメント 3 件 ·
-
add praseq as an option for input対応中かも @BenjaminDEMAILLE が 7 日前に担当しました。 オープンenhancement
難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 48/100
scverse/rustar-aligner#95 ·
-
`Log.final.out` folds all unmapped reads into `too short`; `other` bucket always 0対応中かも @BenjaminDEMAILLE が 40 日前に担当しました。 オープン
難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 64/100
scverse/rustar-aligner#48 · コメント 4 件 ·
-
Multi-mapper NH cap differs from STAR (NH up to 20 vs STAR's 7); possibly missing `--outFilterMultimapScoreRange`対応中かも @BenjaminDEMAILLE が 40 日前に担当しました。 オープン
難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 45/100
scverse/rustar-aligner#31 · コメント 5 件 ·
-
Output `anndata` files対応中かも @ilan-gold が 147 日前に担当しました。 オープンfile-formats
scverse/rustar-aligner#1 · コメント 5 件 · 担当者 1 名 ·