ST0013 As a user I would like to see the IRods root collection path for my samples so that I can find my sequencing data.
まだ誰も着手していません。
評価
- 難易度
- 3/5
- 見積もり時間
- 1〜2日
- 初心者へのやさしさ
- 35/100
- issue の種類
- 機能追加
- 明瞭さ
- おおむね明確
- 活発さ
- 停滞
調査の方向性
Sample Tracking ビューと issue にリンクされているサンプルクエリから始め、シーケンス済みのサンプルに IRods Root Collection Paths 列のエントリがあることを確認します。新しい列を Confluence レポートとビューの説明に反映し、サニティチェックの結果を記録します。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
As a user I would like to see the IRods root collection path for my samples so that I can find my sequencing data.
Acceptance Criteria
- Add a new column to the Sample Tracking view in the database named "IRods Root Collection Paths"
- Each row should contain the distinct concatenated strings from the table seq_product_irods_locations.irods_root_collection
- Confluence page description of the report and view should be updated to include the new column
- Sanity check: It is expected that if a sample has been sequenced there should be an entry in this column.
Additional Info
An example query that pulls back the IRods path is here.
https://ssg-confluence.internal.sanger.ac.uk/display/PSDPUB/How+to+query+for+all+sequencing+run+status+changes+for+a+given+study+after+a+given+time+point
- 主要言語
- Python
- スター
- 0
- フォーク
- 0
- PR マージ指標
- 30日以内にマージされた PR はありません
環境構築
- Dockerfile・Docker Compose ファイルなし
- プルリクエストのテンプレートなし
- コントリビューションガイドを読む
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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