ST0013 As a user I would like to see the IRods root collection path for my samples so that I can find my sequencing data.
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Valutazione
- Difficoltà
- 3/5
- Tempo stimato
- 1-2 giorni
- Idoneità per principianti
- 35/100
- Tipo di issue
- Funzionalità
- Chiarezza
- Abbastanza chiara
- Stato di attività
- Ferma
- Ambito
- databases, documentation
Direzione di ricerca
Inizia dalla vista Sample Tracking e dalla query di esempio collegata nell’issue, quindi verifica che i campioni sequenziati abbiano una voce nella colonna IRods Root Collection Paths. Aggiorna il report Confluence e la descrizione della vista con la nuova colonna e registra il risultato del sanity check.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
As a user I would like to see the IRods root collection path for my samples so that I can find my sequencing data.
Acceptance Criteria
- Add a new column to the Sample Tracking view in the database named "IRods Root Collection Paths"
- Each row should contain the distinct concatenated strings from the table seq_product_irods_locations.irods_root_collection
- Confluence page description of the report and view should be updated to include the new column
- Sanity check: It is expected that if a sample has been sequenced there should be an entry in this column.
Additional Info
An example query that pulls back the IRods path is here.
https://ssg-confluence.internal.sanger.ac.uk/display/PSDPUB/How+to+query+for+all+sequencing+run+status+changes+for+a+given+study+after+a+given+time+point
- Lingua principale
- Python
- Stelle
- 0
- Fork
- 0
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Preparare l'ambiente
- Nessun Dockerfile né file Docker Compose
- Nessun modello di pull request
- Leggi la guida per i contributori
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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