ST0013 As a user I would like to see the IRods root collection path for my samples so that I can find my sequencing data.
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 3/5
- Thời gian dự kiến
- 1-2 ngày
- Mức phù hợp với người mới
- 35/100
- Loại issue
- Tính năng
- Độ rõ ràng
- Khá rõ ràng
- Mức độ hoạt động
- Đình trệ
- Lĩnh vực
- databases, documentation
Hướng nghiên cứu
Bắt đầu với view Sample Tracking và truy vấn mẫu được liên kết trong issue, sau đó xác minh rằng các sample đã được giải trình tự có một mục trong cột IRods Root Collection Paths. Cập nhật báo cáo Confluence và phần mô tả view với cột mới, đồng thời ghi lại kết quả kiểm tra sanity.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
As a user I would like to see the IRods root collection path for my samples so that I can find my sequencing data.
Acceptance Criteria
- Add a new column to the Sample Tracking view in the database named "IRods Root Collection Paths"
- Each row should contain the distinct concatenated strings from the table seq_product_irods_locations.irods_root_collection
- Confluence page description of the report and view should be updated to include the new column
- Sanity check: It is expected that if a sample has been sequenced there should be an entry in this column.
Additional Info
An example query that pulls back the IRods path is here.
https://ssg-confluence.internal.sanger.ac.uk/display/PSDPUB/How+to+query+for+all+sequencing+run+status+changes+for+a+given+study+after+a+given+time+point
- Ngôn ngữ chính
- Python
- Star
- 0
- Fork
- 0
- Chỉ số merge pull request
- Không có pull request nào được merge trong 30 ngày
Chuẩn bị môi trường
- Không có Dockerfile hay tệp Docker Compose
- Không có mẫu pull request
- Đọc hướng dẫn đóng góp
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của sanger/sample-tracking
-
Y26-127 - As a manager in short read in charge of billing, I want the billing report to correctly handle Bioscan samples.Có thể làm lại được @dn10-sanger đã nhận 210 ngày trước và không có pull request nào đang mở. Đang mởenhancement good first issue Research
sanger/sample-tracking#54 · 3 bình luận · 1 reaction · 1 người được giao ·
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 38/100
sanger/sample-tracking#11 ·
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100
sanger/sample-tracking#7 · 3 bình luận ·
-
ST0011—Deployment processĐang mở
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 20/100
Tất cả issue của sanger/sample-tracking
Issue tương tự
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100
FinanceFlash/unvibecode#509 ·
-
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 82/100
FAIRmat-NFDI/nomad-distro-dev#161 ·
-
bug v2
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 76/100
modelcontextprotocol/python-sdk#3821 · 1 bình luận ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
bug severity:low
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 68/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày
-
Log-odds calibration uses upper middle score instead of median for even candidate setsCó thể đã có người làm @flysheep-ai đã nhận hôm nay. Đang mở
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 82/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày