Hacktoberfest 2026:メンテナが10月に向けて印を付けた、オープンで初心者向けの issue。 Hacktoberfest の issue を見る

Test data to be used for automated testing with the nf-core pipelines

nf-core/test-datasets は初心者に優しい?

直近 30 日間に、nf-core/test-datasets は外部コントリビューターの PR 51 件のうち 39 件をマージしました。メンテナーはふだん 1 日以内に返信します。 初心者向けの issue が現在 3 件オープンです。

スター
163
フォーク
541
オープンの初心者向け issue
3
索引済み issue
43
平均マージ
7時間 6分
マージ済み PR(30日)
47
主要言語
言語のデータがありません
ライセンス
MIT
最終 GitHub push
2026年10月7日
最新の索引
2026年9月19日
コントリビューションガイド
コントリビューションガイドがありません
行動規範
行動規範がありません
初心者向けラベル
初心者向けラベルは索引されていません

nf-core/test-datasets にコントリビュートするには

  1. コントリビューションガイドはないので、README と最近マージされた PR をいくつか読んで、変更の出し方をつかみましょう。
  2. あなたのコントリビュートはプロジェクトの MIT ライセンスで公開されます。
  3. 下にある 3 件の初心者向けのオープンな issue から 1 つ選び、作業を始める前に取り組みたいとコメントしましょう。
issue を読み込んでいます

誰かが対応中かもしれないイシューは最後に並べています。 すべて日付順に表示

  • Action Required: Fix Renovate Configuration
    オープン

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 65/100

    nf-core/test-datasets#2225 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Add dartseq reference genome/gtf
    オープン

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 62/100

    nf-core/test-datasets#2221 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Renovate Dashboard 🤖
    オープン

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

    nf-core/test-datasets#2148 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • [404] Page not found: https://github.com/nf-core/test-datasets/blob/master/docs/ADD_NEW_DATA.md
    オープン

    難易度 1/5 1時間未満 初心者へのやさしさ 78/100

    nf-core/test-datasets#2144 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • [modules] Files misplaced in README
    オープン

    難易度 1/5 1時間未満 初心者へのやさしさ 35/100

    nf-core/test-datasets#1977 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • [modules] Files not described in README
    オープン

    難易度 1/5 1時間未満 初心者へのやさしさ 82/100

    nf-core/test-datasets#1976 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Add `RunParameters.xml` file to BCL test sets
    再び着手できるかも @delfiterradas が 240 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

    nf-core/test-datasets#1883 · コメント 1 件 · 担当者 1 名 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • add cpgr test files for variantprioritization
    再び着手できるかも @YussAb が 252 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

    nf-core/test-datasets#1870 · 担当者 1 名 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • source for oncoanalyser test data ?
    オープン

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 25/100

    nf-core/test-datasets#1768 · コメント 2 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Wrong GFF3 file
    オープン

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 35/100

    nf-core/test-datasets#1561 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • [modules] Imaging data are not described in the README
    オープン

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

    nf-core/test-datasets#1543 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • aws s3 links
    オープン

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

    nf-core/test-datasets#1252 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Is there a better way to provide test-data for modules than we currently have, with the two stage process.
    オープン

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

    nf-core/test-datasets#1251 · コメント 1 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • If we are not allowing links to external git files, then we need to deal with all those files
    オープン

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

    nf-core/test-datasets#1250 · コメント 1 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Very carefully delete any branches that are unnecessary (especially ones that have already been merged)
    オープン

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 35/100

    nf-core/test-datasets#1249 · コメント 3 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Generate a page on the website to be able to view the current test data
    オープン

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

    nf-core/test-datasets#1248 · リアクション 2 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Organise and document the files that we currently have better, rather than one massive README with single lines of text.
    オープン

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    nf-core/test-datasets#1247 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Determine what we want to do with tools with very specific test data files
    オープン

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

    nf-core/test-datasets#1246 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Rearrange and rename the `delete_me` folder
    オープン

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

    nf-core/test-datasets#1245 · コメント 2 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Set up a GitHub bot to automatically post links to new PRs into the #request-review or #test-datasets slack channels.
    オープン

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 30/100

    nf-core/test-datasets#1244 · リアクション 1 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Modules test-data task force master list
    オープン

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 15/100

    nf-core/test-datasets#1243 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Need testdata for mcmicro-celesta
    オープン

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 15/100

    nf-core/test-datasets#1131 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Test data required for testing scimap/spatiallda module
    再び着手できるかも @chiarasch が 950 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン
    imaging

    nf-core/test-datasets#1130 · 担当者 2 名 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • CAT - Contig Annotation Tool custom database
    オープン

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 30/100

    nf-core/test-datasets#1102 · コメント 1 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Request to add ONT-Amplicon seq for SARS-CoV-2:Wastewater
    再び着手できるかも @arunbodd が 975 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

    nf-core/test-datasets#1087 · 担当者 1 名 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • What should we do with `docs/ADD_NEW_DATA.md` and `docs/USE_EXISTING_DATA.md` on pipeline branches?
    オープン

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    nf-core/test-datasets#1069 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Add new test data for modkit_pileup
    オープン

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 35/100

    nf-core/test-datasets#1050 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Homo sapiens Genome.gtf test-dataset is invalid
    オープン

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 45/100

    nf-core/test-datasets#1028 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • add a new dataset for est-sfs
    再び着手できるかも @BioInf2305 が 1104 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

    nf-core/test-datasets#1019 · 担当者 1 名 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • [`taxprofiler` branch] Add new taxprofiler `sourmash` db
    再び着手できるかも @vmikk が 1105 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

    nf-core/test-datasets#1018 · 担当者 1 名 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Use version tags on branches
    オープン

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    nf-core/test-datasets#993 · コメント 1 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Use git-lfs
    オープン

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

    nf-core/test-datasets#992 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Pipedreams
    オープン

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 15/100

    nf-core/test-datasets#991 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Add cyano nucleotide taxonomy to phyloplace test data
    再び着手できるかも @erikrikarddaniel が 1308 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

    nf-core/test-datasets#814 · 担当者 1 名 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Re-run tests of all affected modules when a given test-data file is updated/modified
    オープン

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    nf-core/test-datasets#626 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Split modules vs pipeline test module
    オープン

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    nf-core/test-datasets#625 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Clean up bam/cram homo_sapiens files for modules tests data
    オープン

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 30/100

    nf-core/test-datasets#525 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Update & complete documentation on modules test-data for homo-sapiens
    オープン

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

    nf-core/test-datasets#357 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Documentation for applying sarek to nf-core test data
    再び着手できるかも @maxulysse が 2098 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

    nf-core/test-datasets#212 · コメント 2 件 · 担当者 1 名 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • error in gff file (rnaseq branch test-datasets/reference/genes.gff)
    オープン

    難易度 1/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 25/100

    nf-core/test-datasets#117 · コメント 2 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Undo PR 1825 because it is wrong
    対応中かも @FernandoDuarteF が 234 日前に担当しました。 オープン

    nf-core/test-datasets#1889 · 担当者 1 名 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Add testing dataset for cellranger multi
    対応中かも @fmalmeida が 457 日前に担当しました。 オープン

    nf-core/test-datasets#1689 · 担当者 1 名 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Add new test data for sammyseq
    対応中かも @daisymut が 1306 日前に担当しました。 オープン

    nf-core/test-datasets#832 · 担当者 1 名 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

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