Hacktoberfest 2026: le issue che i maintainer hanno segnato per ottobre, aperte e adatte ai principianti. Sfoglia le issue Hacktoberfest

nf-core/test-datasets

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Test data to be used for automated testing with the nf-core pipelines

nf-core/test-datasets è adatto ai principianti?

Negli ultimi 30 giorni nf-core/test-datasets ha accettato 39 delle 51 pull request di contributori esterni, e i suoi maintainer di solito rispondono entro 1 giorno. In questo momento sono aperte 3 issue adatte ai principianti.

Stelle
163
Fork
541
Issue aperte per principianti
3
Issue indicizzate
43
Merge medio
7h 6m
PR unite (30g)
47
Lingua principale
Nessun dato sulla lingua
Licenza
MIT
Ultimo push su GitHub
7/10/2026
Ultima indicizzazione
19/9/2026
Nessuna guida per i contributori
Nessun codice di condotta
Label per principianti
Nessuna label per principianti indicizzata

Come contribuire a nf-core/test-datasets

  1. Non c'è una guida per contribuire: parti dal README e da alcune pull request accettate di recente per capire come si propongono le modifiche.
  2. I tuoi contributi saranno pubblicati con la licenza MIT del progetto.
  3. Scegli una delle 3 issue aperte adatte ai principianti qui sotto e, prima di iniziare, scrivi in un commento che vuoi occupartene.
Adatte ai principianti Tutto
Aperta Tutte

Le issue su cui forse qualcuno sta già lavorando sono in fondo alla lista. Ordina tutto per data

  • Action Required: Fix Renovate Configuration
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 65/100

    nf-core/test-datasets#2225 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Add dartseq reference genome/gtf
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 62/100

    nf-core/test-datasets#2221 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Renovate Dashboard 🤖
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

    nf-core/test-datasets#2148 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • [404] Page not found: https://github.com/nf-core/test-datasets/blob/master/docs/ADD_NEW_DATA.md
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 78/100

    nf-core/test-datasets#2144 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • [modules] Files misplaced in README
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 35/100

    nf-core/test-datasets#1977 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • [modules] Files not described in README
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 82/100

    nf-core/test-datasets#1976 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Add `RunParameters.xml` file to BCL test sets
    Forse di nuovo libera Aperta
    • Qualcosa non va?

    nf-core/test-datasets#1883 · 1 commento · 1 assegnatario ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • add cpgr test files for variantprioritization
    Forse di nuovo libera Aperta
    • Qualcosa non va?

    nf-core/test-datasets#1870 · 1 assegnatario ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • source for oncoanalyser test data ?
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 25/100

    nf-core/test-datasets#1768 · 2 commenti ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Wrong GFF3 file
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 35/100

    nf-core/test-datasets#1561 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • [modules] Imaging data are not described in the README
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

    nf-core/test-datasets#1543 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • aws s3 links
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

    nf-core/test-datasets#1252 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Is there a better way to provide test-data for modules than we currently have, with the two stage process.
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

    nf-core/test-datasets#1251 · 1 commento ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • If we are not allowing links to external git files, then we need to deal with all those files
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    nf-core/test-datasets#1250 · 1 commento ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Very carefully delete any branches that are unnecessary (especially ones that have already been merged)
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 35/100

    nf-core/test-datasets#1249 · 3 commenti ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Generate a page on the website to be able to view the current test data
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

    nf-core/test-datasets#1248 · 2 reazioni ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Organise and document the files that we currently have better, rather than one massive README with single lines of text.
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

    nf-core/test-datasets#1247 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Determine what we want to do with tools with very specific test data files
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

    nf-core/test-datasets#1246 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Rearrange and rename the `delete_me` folder
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    nf-core/test-datasets#1245 · 2 commenti ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Set up a GitHub bot to automatically post links to new PRs into the #request-review or #test-datasets slack channels.
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100

    nf-core/test-datasets#1244 · 1 reazione ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Modules test-data task force master list
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 15/100

    nf-core/test-datasets#1243 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Need testdata for mcmicro-celesta
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 15/100

    nf-core/test-datasets#1131 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Test data required for testing scimap/spatiallda module
    Forse di nuovo libera Aperta
    • Qualcosa non va?
    imaging

    nf-core/test-datasets#1130 · 2 assegnatari ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • CAT - Contig Annotation Tool custom database
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

    nf-core/test-datasets#1102 · 1 commento ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Request to add ONT-Amplicon seq for SARS-CoV-2:Wastewater
    Forse di nuovo libera Aperta
    • Qualcosa non va?

    nf-core/test-datasets#1087 · 1 assegnatario ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • What should we do with `docs/ADD_NEW_DATA.md` and `docs/USE_EXISTING_DATA.md` on pipeline branches?
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

    nf-core/test-datasets#1069 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Add new test data for modkit_pileup
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 35/100

    nf-core/test-datasets#1050 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Homo sapiens Genome.gtf test-dataset is invalid
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 45/100

    nf-core/test-datasets#1028 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • add a new dataset for est-sfs
    Forse di nuovo libera Aperta
    • Qualcosa non va?

    nf-core/test-datasets#1019 · 1 assegnatario ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • [`taxprofiler` branch] Add new taxprofiler `sourmash` db
    Forse di nuovo libera Aperta
    • Qualcosa non va?

    nf-core/test-datasets#1018 · 1 assegnatario ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Use version tags on branches
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

    nf-core/test-datasets#993 · 1 commento ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Use git-lfs
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

    nf-core/test-datasets#992 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Pipedreams
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 15/100

    nf-core/test-datasets#991 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Add cyano nucleotide taxonomy to phyloplace test data
    Forse di nuovo libera Aperta
    • Qualcosa non va?

    nf-core/test-datasets#814 · 1 assegnatario ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Re-run tests of all affected modules when a given test-data file is updated/modified
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

    nf-core/test-datasets#626 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Split modules vs pipeline test module
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

    nf-core/test-datasets#625 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Clean up bam/cram homo_sapiens files for modules tests data
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

    nf-core/test-datasets#525 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Update & complete documentation on modules test-data for homo-sapiens
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    nf-core/test-datasets#357 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Documentation for applying sarek to nf-core test data
    Forse di nuovo libera Aperta
    • Qualcosa non va?

    nf-core/test-datasets#212 · 2 commenti · 1 assegnatario ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • error in gff file (rnaseq branch test-datasets/reference/genes.gff)
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 1/5 1-3 ore Idoneità per principianti 25/100

    nf-core/test-datasets#117 · 2 commenti ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Undo PR 1825 because it is wrong
    Forse già presa Aperta
    • Qualcosa non va?

    nf-core/test-datasets#1889 · 1 assegnatario ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Add testing dataset for cellranger multi
    Forse già presa Aperta
    • Qualcosa non va?

    nf-core/test-datasets#1689 · 1 assegnatario ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Add new test data for sammyseq
    Forse già presa Aperta
    • Qualcosa non va?

    nf-core/test-datasets#832 · 1 assegnatario ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

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