Hacktoberfest 2026: los issues que los mantenedores marcaron para octubre, abiertos y aptos para principiantes. Explorar issues de Hacktoberfest

nf-core/test-datasets

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Test data to be used for automated testing with the nf-core pipelines

¿Es nf-core/test-datasets apto para principiantes?

En los últimos 30 días, nf-core/test-datasets fusionó 39 de 51 pull requests de colaboradores externos, y sus mantenedores suelen responder en 1 día. Ahora mismo hay 3 issues aptos para principiantes abiertos.

Estrellas
163
Forks
541
Issues abiertos para principiantes
3
Issues indexados
43
Merge medio
7 h 6 min
PR fusionados (30 d)
47
Lenguaje dominante
Sin datos de lenguaje
Licencia
MIT
Último push a GitHub
7/10/2026
Última indexación
19/9/2026
Sin guía de contribución
Sin código de conducta
Etiquetas para principiantes
Sin etiquetas para principiantes indexadas

Cómo contribuir a nf-core/test-datasets

  1. No hay guía de contribución, así que empieza por el README y por algunos pull requests fusionados hace poco para ver cómo se proponen los cambios.
  2. Tus contribuciones se publicarán bajo la licencia MIT del proyecto.
  3. Elige uno de los 3 issues abiertos aptos para principiantes de abajo y comenta que quieres trabajar en él antes de empezar.
Para principiantes Todo
Abierto Todos

Las issues en las que quizá ya trabaja alguien aparecen al final. Ordenar todo por fecha

  • Action Required: Fix Renovate Configuration
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 65/100

    nf-core/test-datasets#2225 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Add dartseq reference genome/gtf
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 62/100

    nf-core/test-datasets#2221 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Renovate Dashboard 🤖
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    nf-core/test-datasets#2148 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • [404] Page not found: https://github.com/nf-core/test-datasets/blob/master/docs/ADD_NEW_DATA.md
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 78/100

    nf-core/test-datasets#2144 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • [modules] Files misplaced in README
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 35/100

    nf-core/test-datasets#1977 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • [modules] Files not described in README
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 82/100

    nf-core/test-datasets#1976 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Add `RunParameters.xml` file to BCL test sets
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    nf-core/test-datasets#1883 · 1 comentario · 1 asignado ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • add cpgr test files for variantprioritization
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    nf-core/test-datasets#1870 · 1 asignado ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • source for oncoanalyser test data ?
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 25/100

    nf-core/test-datasets#1768 · 2 comentarios ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Wrong GFF3 file
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 35/100

    nf-core/test-datasets#1561 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • [modules] Imaging data are not described in the README
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    nf-core/test-datasets#1543 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • aws s3 links
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    nf-core/test-datasets#1252 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Is there a better way to provide test-data for modules than we currently have, with the two stage process.
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

    nf-core/test-datasets#1251 · 1 comentario ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • If we are not allowing links to external git files, then we need to deal with all those files
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

    nf-core/test-datasets#1250 · 1 comentario ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Very carefully delete any branches that are unnecessary (especially ones that have already been merged)
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 35/100

    nf-core/test-datasets#1249 · 3 comentarios ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Generate a page on the website to be able to view the current test data
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

    nf-core/test-datasets#1248 · 2 reacciones ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Organise and document the files that we currently have better, rather than one massive README with single lines of text.
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    nf-core/test-datasets#1247 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Determine what we want to do with tools with very specific test data files
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

    nf-core/test-datasets#1246 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Rearrange and rename the `delete_me` folder
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

    nf-core/test-datasets#1245 · 2 comentarios ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Set up a GitHub bot to automatically post links to new PRs into the #request-review or #test-datasets slack channels.
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 30/100

    nf-core/test-datasets#1244 · 1 reacción ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Modules test-data task force master list
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 15/100

    nf-core/test-datasets#1243 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Need testdata for mcmicro-celesta
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 15/100

    nf-core/test-datasets#1131 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Test data required for testing scimap/spatiallda module
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    imaging

    nf-core/test-datasets#1130 · 2 asignados ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • CAT - Contig Annotation Tool custom database
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

    nf-core/test-datasets#1102 · 1 comentario ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Request to add ONT-Amplicon seq for SARS-CoV-2:Wastewater
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    nf-core/test-datasets#1087 · 1 asignado ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • What should we do with `docs/ADD_NEW_DATA.md` and `docs/USE_EXISTING_DATA.md` on pipeline branches?
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    nf-core/test-datasets#1069 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Add new test data for modkit_pileup
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 35/100

    nf-core/test-datasets#1050 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Homo sapiens Genome.gtf test-dataset is invalid
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

    nf-core/test-datasets#1028 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • add a new dataset for est-sfs
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    nf-core/test-datasets#1019 · 1 asignado ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • [`taxprofiler` branch] Add new taxprofiler `sourmash` db
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    nf-core/test-datasets#1018 · 1 asignado ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Use version tags on branches
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    nf-core/test-datasets#993 · 1 comentario ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Use git-lfs
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

    nf-core/test-datasets#992 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Pipedreams
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 15/100

    nf-core/test-datasets#991 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Add cyano nucleotide taxonomy to phyloplace test data
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    nf-core/test-datasets#814 · 1 asignado ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Re-run tests of all affected modules when a given test-data file is updated/modified
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    nf-core/test-datasets#626 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Split modules vs pipeline test module
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    nf-core/test-datasets#625 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Clean up bam/cram homo_sapiens files for modules tests data
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

    nf-core/test-datasets#525 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Update & complete documentation on modules test-data for homo-sapiens
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

    nf-core/test-datasets#357 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Documentation for applying sarek to nf-core test data
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    nf-core/test-datasets#212 · 2 comentarios · 1 asignado ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • error in gff file (rnaseq branch test-datasets/reference/genes.gff)
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 1/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 25/100

    nf-core/test-datasets#117 · 2 comentarios ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Undo PR 1825 because it is wrong
    Posiblemente ocupada Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    nf-core/test-datasets#1889 · 1 asignado ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Add testing dataset for cellranger multi
    Posiblemente ocupada Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    nf-core/test-datasets#1689 · 1 asignado ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Add new test data for sammyseq
    Posiblemente ocupada Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    nf-core/test-datasets#832 · 1 asignado ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

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