Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

nf-core/test-datasets

Đăng nhập để theo dõi Xem trên GitHub

Test data to be used for automated testing with the nf-core pipelines

nf-core/test-datasets có thân thiện với người mới không?

Trong 30 ngày gần nhất, nf-core/test-datasets đã merge 42 trên 50 pull request của người đóng góp bên ngoài, và maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày. Hiện có 3 issue phù hợp với người mới đang mở.

Star
163
Fork
542
Issue cho người mới đang mở
3
Issue đã lập chỉ mục
43
Merge trung bình
15 giờ 43 phút
Pull request đã merge (30 ngày)
50
Ngôn ngữ chính
Không có dữ liệu ngôn ngữ
Giấy phép
MIT
Lần push lên GitHub gần nhất
7/10/2026
Lập chỉ mục gần nhất
19/9/2026
Không có hướng dẫn đóng góp
Không có quy tắc ứng xử
Label cho người mới
Chưa lập chỉ mục label nào cho người mới

Cách đóng góp cho nf-core/test-datasets

  1. Dự án không có hướng dẫn đóng góp, vì vậy hãy bắt đầu từ README và vài pull request vừa được merge để xem thay đổi được đề xuất thế nào.
  2. Đóng góp của bạn sẽ được phát hành theo giấy phép MIT của dự án.
  3. Chọn một trong 3 issue phù hợp với người mới đang mở bên dưới và bình luận rằng bạn muốn làm nó trước khi bắt đầu.
Phù hợp cho người mới Tất cả
Đang mở Tất cả

Các issue có thể đã có người làm được xếp cuối danh sách. Sắp xếp tất cả theo ngày

  • Action Required: Fix Renovate Configuration
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 65/100

    nf-core/test-datasets#2225 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Add dartseq reference genome/gtf
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 62/100

    nf-core/test-datasets#2221 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Renovate Dashboard 🤖
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    nf-core/test-datasets#2148 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • [404] Page not found: https://github.com/nf-core/test-datasets/blob/master/docs/ADD_NEW_DATA.md
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 78/100

    nf-core/test-datasets#2144 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • [modules] Files misplaced in README
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 35/100

    nf-core/test-datasets#1977 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • [modules] Files not described in README
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 82/100

    nf-core/test-datasets#1976 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Add `RunParameters.xml` file to BCL test sets
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    nf-core/test-datasets#1883 · 1 bình luận · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • add cpgr test files for variantprioritization
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    nf-core/test-datasets#1870 · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • source for oncoanalyser test data ?
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 25/100

    nf-core/test-datasets#1768 · 2 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Wrong GFF3 file
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 35/100

    nf-core/test-datasets#1561 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • [modules] Imaging data are not described in the README
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    nf-core/test-datasets#1543 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • aws s3 links
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    nf-core/test-datasets#1252 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Is there a better way to provide test-data for modules than we currently have, with the two stage process.
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 20/100

    nf-core/test-datasets#1251 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • If we are not allowing links to external git files, then we need to deal with all those files
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100

    nf-core/test-datasets#1250 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Very carefully delete any branches that are unnecessary (especially ones that have already been merged)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 35/100

    nf-core/test-datasets#1249 · 3 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Generate a page on the website to be able to view the current test data
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 20/100

    nf-core/test-datasets#1248 · 2 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Organise and document the files that we currently have better, rather than one massive README with single lines of text.
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    nf-core/test-datasets#1247 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Determine what we want to do with tools with very specific test data files
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 20/100

    nf-core/test-datasets#1246 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Rearrange and rename the `delete_me` folder
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100

    nf-core/test-datasets#1245 · 2 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Set up a GitHub bot to automatically post links to new PRs into the #request-review or #test-datasets slack channels.
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 30/100

    nf-core/test-datasets#1244 · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Modules test-data task force master list
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 15/100

    nf-core/test-datasets#1243 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Need testdata for mcmicro-celesta
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 15/100

    nf-core/test-datasets#1131 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Test data required for testing scimap/spatiallda module
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?
    imaging

    nf-core/test-datasets#1130 · 2 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • CAT - Contig Annotation Tool custom database
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 30/100

    nf-core/test-datasets#1102 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Request to add ONT-Amplicon seq for SARS-CoV-2:Wastewater
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    nf-core/test-datasets#1087 · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • What should we do with `docs/ADD_NEW_DATA.md` and `docs/USE_EXISTING_DATA.md` on pipeline branches?
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    nf-core/test-datasets#1069 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Add new test data for modkit_pileup
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 35/100

    nf-core/test-datasets#1050 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Homo sapiens Genome.gtf test-dataset is invalid
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 45/100

    nf-core/test-datasets#1028 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • add a new dataset for est-sfs
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    nf-core/test-datasets#1019 · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • [`taxprofiler` branch] Add new taxprofiler `sourmash` db
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    nf-core/test-datasets#1018 · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Use version tags on branches
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    nf-core/test-datasets#993 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Use git-lfs
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 20/100

    nf-core/test-datasets#992 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Pipedreams
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 15/100

    nf-core/test-datasets#991 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Add cyano nucleotide taxonomy to phyloplace test data
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    nf-core/test-datasets#814 · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Re-run tests of all affected modules when a given test-data file is updated/modified
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    nf-core/test-datasets#626 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Split modules vs pipeline test module
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    nf-core/test-datasets#625 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Clean up bam/cram homo_sapiens files for modules tests data
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 30/100

    nf-core/test-datasets#525 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Update & complete documentation on modules test-data for homo-sapiens
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100

    nf-core/test-datasets#357 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Documentation for applying sarek to nf-core test data
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    nf-core/test-datasets#212 · 2 bình luận · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • error in gff file (rnaseq branch test-datasets/reference/genes.gff)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 1/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 25/100

    nf-core/test-datasets#117 · 2 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Undo PR 1825 because it is wrong
    Có thể đã có người làm Đang mở
    • Có gì không ổn?

    nf-core/test-datasets#1889 · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Add testing dataset for cellranger multi
    Có thể đã có người làm Đang mở
    • Có gì không ổn?

    nf-core/test-datasets#1689 · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Add new test data for sammyseq
    Có thể đã có người làm Đang mở
    • Có gì không ổn?

    nf-core/test-datasets#832 · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.