Hacktoberfest 2026:メンテナが10月に向けて印を付けた、オープンで初心者向けの issue。 Hacktoberfest の issue を見る

Adding MiniKrakenDB and SILVA to Kraken Data manager?

オープン
#443 コメント 1 件 リアクション 0 件 担当者 0 名 GitHub で見る

まだ誰も着手していません。

評価

難易度
5/5
見積もり時間
1週間以上
初心者へのやさしさ
25/100
issue の種類
機能追加
明瞭さ
説明が足りない
活発さ
停滞
領域
databases

調査の方向性

まず Kraken Data manager の場所を特定し、デフォルトの Bacteria データベースをどのように扱っているかを確認します。ビルド済みの MiniKrakenDB のダウンロードまたは SILVA データベースのビルドを、そのワークフローにどのように組み込めるかを判断します。要求されたオプションがサポートされ、報告されているサイズおよびメモリのエラーを回避できれば完了です。

索引モデルが issue の本文から書いたものです。

説明

@blankenberg Is it possible the Kraken Data manager an option for downloading pre-built MiniKraken DB (4 GB) (or building SILVA) to be added?

I have tried to download Bacteria default database but I got an error since the database is quite size and memory demanding so the pre-built MiniKrakenDB is probably an option?

主要言語
Python
スター
37
フォーク
94
PR マージ指標
30日以内にマージされた PR はありません

環境構築

はじめの一歩

  1. issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
  2. 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
  3. リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
  4. issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。

galaxyproject/tools-devteam のほかの issue

galaxyproject/tools-devteam の issue をすべて見る

似ている issue

Python の issue をもっと見る

新しい issue をメールで受け取る

初心者向けの GitHub issue を短くまとめたダイジェスト。