Adding MiniKrakenDB and SILVA to Kraken Data manager?
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 5/5
- Thời gian dự kiến
- Hơn một tuần
- Mức phù hợp với người mới
- 25/100
- Loại issue
- Tính năng
- Độ rõ ràng
- Cần làm rõ
- Mức độ hoạt động
- Đình trệ
- Lĩnh vực
- databases
Hướng nghiên cứu
Bắt đầu bằng cách xác định Kraken Data manager và xem xét cách nó xử lý cơ sở dữ liệu Bacteria mặc định. Xác định cách một bản tải xuống MiniKrakenDB dựng sẵn hoặc việc xây dựng cơ sở dữ liệu SILVA có thể phù hợp với quy trình đó. Hoàn thành khi tùy chọn được yêu cầu được hỗ trợ và tránh được lỗi về kích thước và bộ nhớ đã được báo cáo.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
@blankenberg Is it possible the Kraken Data manager an option for downloading pre-built MiniKraken DB (4 GB) (or building SILVA) to be added?
I have tried to download Bacteria default database but I got an error since the database is quite size and memory demanding so the pre-built MiniKrakenDB is probably an option?
- Ngôn ngữ chính
- Python
- Star
- 37
- Fork
- 94
- Chỉ số merge pull request
- Không có pull request nào được merge trong 30 ngày
Chuẩn bị môi trường
- Không có Dockerfile hay tệp Docker Compose
- Không có mẫu pull request
- Đọc hướng dẫn đóng góp
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của galaxyproject/tools-devteam
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
galaxyproject/tools-devteam#632 · 1 bình luận ·
-
bug
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
galaxyproject/tools-devteam#626 ·
-
Test against 22.01Đang mở
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 15/100
galaxyproject/tools-devteam#602 · 2 bình luận ·
-
Unused tool parametersĐang mở
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 45/100
galaxyproject/tools-devteam#601 · 1 bình luận ·
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 38/100
galaxyproject/tools-devteam#597 · 4 bình luận ·
Tất cả issue của galaxyproject/tools-devteam
Issue tương tự
-
Claiming namespace `apoint`Đang mởnamespace operations
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 82/100
EclipseFdn/open-vsx.org#13573 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100
collective/icalendar#1854 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100
rancher/rancher-ai-agent#412 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 6 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 84/100
TUDelftGeodesy/DePSI#134 ·
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 88/100
HenriquesLab/rxiv-maker#335 ·