YuLab-SMU/enrichplot

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Visualization of Functional Enrichment Result

スター: 260
フォーク: 75
オープンの初心者向け issue: 0
索引済み issue: 122

主要言語: R
ライセンス: ライセンスのデータがありません
最終 GitHub push: 2026年6月26日
最新の索引: 2026年9月20日
コントリビューションガイド: コントリビューションガイドがありません
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オープンの issue を 98 件索引しました

No colors with respect to fold change and no circular plot オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#330 · コメント 3 件 · 2025年8月30日に作成
Color and size of nodes and edges dependent on other variables オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 32/100

YuLab-SMU/enrichplot#327 · コメント 2 件 · 2025年7月10日に作成
cex_label_category in emapplot gone オープン

emapplot

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 28/100

YuLab-SMU/enrichplot#322 · コメント 3 件 · 2025年6月1日に作成
how many geneIDsets can be plot at maximum using gseaplot2? オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#319 · コメント 2 件 · 2025年4月29日に作成
Inclusion and exclusion criteria used by dotplot オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#317 · コメント 10 件 · リアクション 1 件 · 2025年4月11日に作成
emapplot is empty even with different files that worked before and generated emapplot. オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#310 · コメント 11 件 · 2025年2月10日に作成
Text label size on emmaplot オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#307 · コメント 2 件 · 2025年1月29日に作成
Dotplot Circle Size Ambiguous オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#305 · コメント 1 件 · 2024年12月12日に作成
How can we customize the color in the dotplot? I want to use the color from the darjeeling1 palette. オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#294 · コメント 2 件 · 2024年9月23日に作成
Ridgeplot Draws Empty Rows オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 42/100

YuLab-SMU/enrichplot#288 · コメント 2 件 · 2024年8月21日に作成
Textbook Lacks Important Details オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 45/100

YuLab-SMU/enrichplot#287 · 2024年8月20日に作成
Textbook barplot Links to Wrong R Package オープン

難易度 1/5 1時間未満初心者へのやさしさ 55/100

YuLab-SMU/enrichplot#286 · 2024年8月20日に作成
How to set range of p.adjust in dotplot? オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#285 · コメント 2 件 · 2024年8月13日に作成
Problem in cnetplot visualisation オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#284 · 2024年7月30日に作成
how can i change the colour of category node of my own choice in cnetplot オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 10/100

YuLab-SMU/enrichplot#282 · コメント 1 件 · 2024年7月24日に作成
change edge color in cnetplot オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#278 · コメント 8 件 · 2024年7月4日に作成
p.adjust value not being rounded in `dotplot` オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#277 · コメント 1 件 · 2024年6月6日に作成
Use this package with Seurat? オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 15/100

YuLab-SMU/enrichplot#276 · コメント 1 件 · 2024年5月24日に作成
gene name in cnetplot--with own GO annotation data オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 32/100

YuLab-SMU/enrichplot#275 · コメント 2 件 · 2024年5月23日に作成
How can I change the width of each coloum in the heatmap in the treeplot? オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#274 · コメント 1 件 · 2024年5月8日に作成
compareCluster dotplot: how to modify the genesets order オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 40/100

YuLab-SMU/enrichplot#272 · コメント 1 件 · 2024年4月11日に作成
unexpected change of default colors/theme with enrichplot オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#268 · コメント 7 件 · 2024年1月24日に作成
why does my treeplot only appear partially? オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#264 · コメント 2 件 · 2023年12月6日に作成
emapplot and cnetplot customization (compareCluster) オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 30/100

YuLab-SMU/enrichplot#261 · コメント 5 件 · 2023年10月28日に作成
show all nodes but show select labels in emapplot オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 45/100

YuLab-SMU/enrichplot#257 · コメント 3 件 · 2023年10月1日に作成
Upsetplot Question オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#252 · 2023年8月24日に作成
Recolouring treeplot オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#250 · コメント 1 件 · 2023年7月30日に作成
Error in offspring.tbl_tree_item(.data = .data, .node = .node, tiponly = tiponly, : could not find function "offspring.tbl_tree_item" オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#249 · コメント 3 件 · リアクション 1 件 · 2023年7月23日に作成
R-4.3.1: could not find function "offspring.tbl_tree_item" オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 28/100

YuLab-SMU/enrichplot#247 · コメント 5 件 · 2023年7月20日に作成
为什么treeplot画出来的Go term,字体没有颜色オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#246 · コメント 3 件 · 2023年7月13日に作成
How to implement treeplot to genes オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#241 · コメント 4 件 · 2023年5月10日に作成
Unable to alter any emapplot cluster parameters オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#240 · コメント 1 件 · 2023年5月5日に作成
gseaplot2()函数中 pvalue_table = T的副产品：显示信号通路名（不想要它，如何去除？）オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#238 · コメント 1 件 · 2023年4月25日に作成
Extract 1 term per cluster in TreePlot オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#237 · 2023年4月18日に作成
treeplot not working オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#234 · コメント 1 件 · 2023年3月21日に作成
How am I supposed to tell the function heatplot() the p-values? オープン

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 45/100

YuLab-SMU/enrichplot#233 · コメント 1 件 · リアクション 1 件 · 2023年3月14日に作成
treeplot.compareClusterResult : dot and tree overlap オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#232 · コメント 5 件 · 2023年3月13日に作成
Getting NA as gene オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#231 · コメント 1 件 · 2023年2月26日に作成
dotplot cannot use pvalue to filter オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#230 · コメント 1 件 · 2023年2月21日に作成
error using emapplot on compareCluster results wit all GO onotologies オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 30/100

YuLab-SMU/enrichplot#228 · コメント 6 件 · 2023年2月17日に作成
Ridgeplot - upload data from external GSEA search? オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 18/100

YuLab-SMU/enrichplot#227 · コメント 1 件 · 2023年2月16日に作成
enrichplot::emapplot() : transparency dependent on q-value? オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#226 · 2023年2月10日に作成
enrichplot::ridgeplot: fill="qvalue" does not work オープン

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#225 · コメント 1 件 · 2023年2月8日に作成
Error in treeplot Overlap between dotplot and dendogram treeplot geneClusterPanel = "dotplot" オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#224 · コメント 3 件 · 2023年2月6日に作成
Emapplot compareCluster : How to remove the legend of the number of genes per circle? オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#222 · コメント 3 件 · 2023年2月2日に作成
How to extract network (in cnetplot + emapplot) for export? オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 38/100

YuLab-SMU/enrichplot#220 · コメント 4 件 · 2022年12月23日に作成
Possible for adding the parameters to adjust the font in the cnetplot and emapplot? オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#215 · 2022年11月29日に作成
Treeplot: possible to add border color around tippoints for a feature/column in enrichResult? オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 38/100

YuLab-SMU/enrichplot#214 · コメント 2 件 · 2022年11月23日に作成
Plots that show circle size "Number of genes" should be "Gene Ratio" for gseaResult オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 48/100

YuLab-SMU/enrichplot#206 · 2022年10月27日に作成
gseaplot2 pvalue_table オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 45/100

YuLab-SMU/enrichplot#203 · コメント 2 件 · 2022年10月18日に作成

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