YuLab-SMU/enrichplot

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Visualization of Functional Enrichment Result

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目前已索引 98 个未关闭的 Issue

No colors with respect to fold change and no circular plot 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#330 · 3 条评论 · 2025年8月30日创建
Color and size of nodes and edges dependent on other variables 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 32/100

YuLab-SMU/enrichplot#327 · 2 条评论 · 2025年7月10日创建
cex_label_category in emapplot gone 未关闭

emapplot

难度 4/5 3-5 天新手友好度 28/100

YuLab-SMU/enrichplot#322 · 3 条评论 · 2025年6月1日创建
how many geneIDsets can be plot at maximum using gseaplot2? 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#319 · 2 条评论 · 2025年4月29日创建
Inclusion and exclusion criteria used by dotplot 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#317 · 10 条评论 · 1 个 reaction · 2025年4月11日创建
emapplot is empty even with different files that worked before and generated emapplot. 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#310 · 11 条评论 · 2025年2月10日创建
Text label size on emmaplot 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#307 · 2 条评论 · 2025年1月29日创建
Dotplot Circle Size Ambiguous 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#305 · 1 条评论 · 2024年12月12日创建
How can we customize the color in the dotplot? I want to use the color from the darjeeling1 palette. 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#294 · 2 条评论 · 2024年9月23日创建
Ridgeplot Draws Empty Rows 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 42/100

YuLab-SMU/enrichplot#288 · 2 条评论 · 2024年8月21日创建
Textbook Lacks Important Details 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 45/100

YuLab-SMU/enrichplot#287 · 2024年8月20日创建
Textbook barplot Links to Wrong R Package 未关闭

难度 1/5 1 小时以内新手友好度 55/100

YuLab-SMU/enrichplot#286 · 2024年8月20日创建
How to set range of p.adjust in dotplot? 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#285 · 2 条评论 · 2024年8月13日创建
Problem in cnetplot visualisation 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#284 · 2024年7月30日创建
how can i change the colour of category node of my own choice in cnetplot 未关闭

难度 5/5 一周以上新手友好度 10/100

YuLab-SMU/enrichplot#282 · 1 条评论 · 2024年7月24日创建
change edge color in cnetplot 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#278 · 8 条评论 · 2024年7月4日创建
p.adjust value not being rounded in `dotplot` 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#277 · 1 条评论 · 2024年6月6日创建
Use this package with Seurat? 未关闭

难度 5/5 一周以上新手友好度 15/100

YuLab-SMU/enrichplot#276 · 1 条评论 · 2024年5月24日创建
gene name in cnetplot--with own GO annotation data 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 32/100

YuLab-SMU/enrichplot#275 · 2 条评论 · 2024年5月23日创建
How can I change the width of each coloum in the heatmap in the treeplot? 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#274 · 1 条评论 · 2024年5月8日创建
compareCluster dotplot: how to modify the genesets order 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 40/100

YuLab-SMU/enrichplot#272 · 1 条评论 · 2024年4月11日创建
unexpected change of default colors/theme with enrichplot 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#268 · 7 条评论 · 2024年1月24日创建
why does my treeplot only appear partially? 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#264 · 2 条评论 · 2023年12月6日创建
emapplot and cnetplot customization (compareCluster) 未关闭

难度 5/5 一周以上新手友好度 30/100

YuLab-SMU/enrichplot#261 · 5 条评论 · 2023年10月28日创建
show all nodes but show select labels in emapplot 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 45/100

YuLab-SMU/enrichplot#257 · 3 条评论 · 2023年10月1日创建
Upsetplot Question 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#252 · 2023年8月24日创建
Recolouring treeplot 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#250 · 1 条评论 · 2023年7月30日创建
Error in offspring.tbl_tree_item(.data = .data, .node = .node, tiponly = tiponly, : could not find function "offspring.tbl_tree_item" 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#249 · 3 条评论 · 1 个 reaction · 2023年7月23日创建
R-4.3.1: could not find function "offspring.tbl_tree_item" 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 28/100

YuLab-SMU/enrichplot#247 · 5 条评论 · 2023年7月20日创建
为什么treeplot画出来的Go term,字体没有颜色未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#246 · 3 条评论 · 2023年7月13日创建
How to implement treeplot to genes 未关闭

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#241 · 4 条评论 · 2023年5月10日创建
Unable to alter any emapplot cluster parameters 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#240 · 1 条评论 · 2023年5月5日创建
gseaplot2()函数中 pvalue_table = T的副产品：显示信号通路名（不想要它，如何去除？）未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#238 · 1 条评论 · 2023年4月25日创建
Extract 1 term per cluster in TreePlot 未关闭

难度 5/5 一周以上新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#237 · 2023年4月18日创建
treeplot not working 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#234 · 1 条评论 · 2023年3月21日创建
How am I supposed to tell the function heatplot() the p-values? 未关闭

难度 2/5 1-3 小时新手友好度 45/100

YuLab-SMU/enrichplot#233 · 1 条评论 · 1 个 reaction · 2023年3月14日创建
treeplot.compareClusterResult : dot and tree overlap 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#232 · 5 条评论 · 2023年3月13日创建
Getting NA as gene 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#231 · 1 条评论 · 2023年2月26日创建
dotplot cannot use pvalue to filter 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#230 · 1 条评论 · 2023年2月21日创建
error using emapplot on compareCluster results wit all GO onotologies 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 30/100

YuLab-SMU/enrichplot#228 · 6 条评论 · 2023年2月17日创建
Ridgeplot - upload data from external GSEA search? 未关闭

难度 5/5 一周以上新手友好度 18/100

YuLab-SMU/enrichplot#227 · 1 条评论 · 2023年2月16日创建
enrichplot::emapplot() : transparency dependent on q-value? 未关闭

难度 5/5 一周以上新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#226 · 2023年2月10日创建
enrichplot::ridgeplot: fill="qvalue" does not work 未关闭

难度 2/5 1-3 小时新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#225 · 1 条评论 · 2023年2月8日创建
Error in treeplot Overlap between dotplot and dendogram treeplot geneClusterPanel = "dotplot" 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#224 · 3 条评论 · 2023年2月6日创建
Emapplot compareCluster : How to remove the legend of the number of genes per circle? 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#222 · 3 条评论 · 2023年2月2日创建
How to extract network (in cnetplot + emapplot) for export? 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 38/100

YuLab-SMU/enrichplot#220 · 4 条评论 · 2022年12月23日创建
Possible for adding the parameters to adjust the font in the cnetplot and emapplot? 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#215 · 2022年11月29日创建
Treeplot: possible to add border color around tippoints for a feature/column in enrichResult? 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 38/100

YuLab-SMU/enrichplot#214 · 2 条评论 · 2022年11月23日创建
Plots that show circle size "Number of genes" should be "Gene Ratio" for gseaResult 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 48/100

YuLab-SMU/enrichplot#206 · 2022年10月27日创建
gseaplot2 pvalue_table 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 45/100

YuLab-SMU/enrichplot#203 · 2 条评论 · 2022年10月18日创建

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