YuLab-SMU/enrichplot

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Visualization of Functional Enrichment Result

星號: 260
分支: 75
開放的新手 issue: 0
已索引 issue: 122

主要語言: R
授權條款: 沒有授權條款資料
最近 GitHub push: 2026年6月26日
最近索引: 2026年9月20日
貢獻指南: 沒有貢獻指南
行為準則: 沒有行為準則
新手標籤: 沒有已索引的新手標籤
PR 合併指標: 30 天內沒有已合併 PR

適合新手全部

未關閉全部

目前已索引 98 個未關閉的 Issue

No colors with respect to fold change and no circular plot 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#330 · 3 則留言 · 2025年8月30日建立
Color and size of nodes and edges dependent on other variables 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 32/100

YuLab-SMU/enrichplot#327 · 2 則留言 · 2025年7月10日建立
cex_label_category in emapplot gone 未關閉

emapplot

難度 4/5 3-5 天新手友好度 28/100

YuLab-SMU/enrichplot#322 · 3 則留言 · 2025年6月1日建立
how many geneIDsets can be plot at maximum using gseaplot2? 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#319 · 2 則留言 · 2025年4月29日建立
Inclusion and exclusion criteria used by dotplot 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#317 · 10 則留言 · 1 個 reaction · 2025年4月11日建立
emapplot is empty even with different files that worked before and generated emapplot. 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#310 · 11 則留言 · 2025年2月10日建立
Text label size on emmaplot 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#307 · 2 則留言 · 2025年1月29日建立
Dotplot Circle Size Ambiguous 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#305 · 1 則留言 · 2024年12月12日建立
How can we customize the color in the dotplot? I want to use the color from the darjeeling1 palette. 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#294 · 2 則留言 · 2024年9月23日建立
Ridgeplot Draws Empty Rows 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 42/100

YuLab-SMU/enrichplot#288 · 2 則留言 · 2024年8月21日建立
Textbook Lacks Important Details 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 45/100

YuLab-SMU/enrichplot#287 · 2024年8月20日建立
Textbook barplot Links to Wrong R Package 未關閉

難度 1/5 1 小時以內新手友好度 55/100

YuLab-SMU/enrichplot#286 · 2024年8月20日建立
How to set range of p.adjust in dotplot? 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#285 · 2 則留言 · 2024年8月13日建立
Problem in cnetplot visualisation 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#284 · 2024年7月30日建立
how can i change the colour of category node of my own choice in cnetplot 未關閉

難度 5/5 一週以上新手友好度 10/100

YuLab-SMU/enrichplot#282 · 1 則留言 · 2024年7月24日建立
change edge color in cnetplot 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#278 · 8 則留言 · 2024年7月4日建立
p.adjust value not being rounded in `dotplot` 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#277 · 1 則留言 · 2024年6月6日建立
Use this package with Seurat? 未關閉

難度 5/5 一週以上新手友好度 15/100

YuLab-SMU/enrichplot#276 · 1 則留言 · 2024年5月24日建立
gene name in cnetplot--with own GO annotation data 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 32/100

YuLab-SMU/enrichplot#275 · 2 則留言 · 2024年5月23日建立
How can I change the width of each coloum in the heatmap in the treeplot? 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#274 · 1 則留言 · 2024年5月8日建立
compareCluster dotplot: how to modify the genesets order 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 40/100

YuLab-SMU/enrichplot#272 · 1 則留言 · 2024年4月11日建立
unexpected change of default colors/theme with enrichplot 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#268 · 7 則留言 · 2024年1月24日建立
why does my treeplot only appear partially? 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#264 · 2 則留言 · 2023年12月6日建立
emapplot and cnetplot customization (compareCluster) 未關閉

難度 5/5 一週以上新手友好度 30/100

YuLab-SMU/enrichplot#261 · 5 則留言 · 2023年10月28日建立
show all nodes but show select labels in emapplot 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 45/100

YuLab-SMU/enrichplot#257 · 3 則留言 · 2023年10月1日建立
Upsetplot Question 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#252 · 2023年8月24日建立
Recolouring treeplot 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#250 · 1 則留言 · 2023年7月30日建立
Error in offspring.tbl_tree_item(.data = .data, .node = .node, tiponly = tiponly, : could not find function "offspring.tbl_tree_item" 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#249 · 3 則留言 · 1 個 reaction · 2023年7月23日建立
R-4.3.1: could not find function "offspring.tbl_tree_item" 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 28/100

YuLab-SMU/enrichplot#247 · 5 則留言 · 2023年7月20日建立
为什么treeplot画出来的Go term,字体没有颜色未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#246 · 3 則留言 · 2023年7月13日建立
How to implement treeplot to genes 未關閉

難度 5/5 一週以上新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#241 · 4 則留言 · 2023年5月10日建立
Unable to alter any emapplot cluster parameters 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#240 · 1 則留言 · 2023年5月5日建立
gseaplot2()函数中 pvalue_table = T的副产品：显示信号通路名（不想要它，如何去除？）未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#238 · 1 則留言 · 2023年4月25日建立
Extract 1 term per cluster in TreePlot 未關閉

難度 5/5 一週以上新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#237 · 2023年4月18日建立
treeplot not working 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#234 · 1 則留言 · 2023年3月21日建立
How am I supposed to tell the function heatplot() the p-values? 未關閉

難度 2/5 1-3 小時新手友好度 45/100

YuLab-SMU/enrichplot#233 · 1 則留言 · 1 個 reaction · 2023年3月14日建立
treeplot.compareClusterResult : dot and tree overlap 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#232 · 5 則留言 · 2023年3月13日建立
Getting NA as gene 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#231 · 1 則留言 · 2023年2月26日建立
dotplot cannot use pvalue to filter 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#230 · 1 則留言 · 2023年2月21日建立
error using emapplot on compareCluster results wit all GO onotologies 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 30/100

YuLab-SMU/enrichplot#228 · 6 則留言 · 2023年2月17日建立
Ridgeplot - upload data from external GSEA search? 未關閉

難度 5/5 一週以上新手友好度 18/100

YuLab-SMU/enrichplot#227 · 1 則留言 · 2023年2月16日建立
enrichplot::emapplot() : transparency dependent on q-value? 未關閉

難度 5/5 一週以上新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#226 · 2023年2月10日建立
enrichplot::ridgeplot: fill="qvalue" does not work 未關閉

難度 2/5 1-3 小時新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#225 · 1 則留言 · 2023年2月8日建立
Error in treeplot Overlap between dotplot and dendogram treeplot geneClusterPanel = "dotplot" 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#224 · 3 則留言 · 2023年2月6日建立
Emapplot compareCluster : How to remove the legend of the number of genes per circle? 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#222 · 3 則留言 · 2023年2月2日建立
How to extract network (in cnetplot + emapplot) for export? 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 38/100

YuLab-SMU/enrichplot#220 · 4 則留言 · 2022年12月23日建立
Possible for adding the parameters to adjust the font in the cnetplot and emapplot? 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#215 · 2022年11月29日建立
Treeplot: possible to add border color around tippoints for a feature/column in enrichResult? 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 38/100

YuLab-SMU/enrichplot#214 · 2 則留言 · 2022年11月23日建立
Plots that show circle size "Number of genes" should be "Gene Ratio" for gseaResult 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 48/100

YuLab-SMU/enrichplot#206 · 2022年10月27日建立
gseaplot2 pvalue_table 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 45/100

YuLab-SMU/enrichplot#203 · 2 則留言 · 2022年10月18日建立

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