YuLab-SMU/enrichplot

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Visualization of Functional Enrichment Result

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Lenguaje dominante: R
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Último push a GitHub: 26/6/2026
Última indexación: 20/9/2026
Guía de contribución: Sin guía de contribución
Código de conducta: Sin código de conducta
Etiquetas para principiantes: Sin etiquetas para principiantes indexadas
Métricas de merge de PR: Sin PR fusionados en 30 d

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98 issues abiertos indexados

No colors with respect to fold change and no circular plot Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#330 · 3 comentarios · Abierto el 30/8/2025
Color and size of nodes and edges dependent on other variables Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 32/100

YuLab-SMU/enrichplot#327 · 2 comentarios · Abierto el 10/7/2025
cex_label_category in emapplot gone Abierto

emapplot

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 28/100

YuLab-SMU/enrichplot#322 · 3 comentarios · Abierto el 1/6/2025
how many geneIDsets can be plot at maximum using gseaplot2? Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#319 · 2 comentarios · Abierto el 29/4/2025
Inclusion and exclusion criteria used by dotplot Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#317 · 10 comentarios · 1 reacción · Abierto el 11/4/2025
emapplot is empty even with different files that worked before and generated emapplot. Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#310 · 11 comentarios · Abierto el 10/2/2025
Text label size on emmaplot Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#307 · 2 comentarios · Abierto el 29/1/2025
Dotplot Circle Size Ambiguous Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#305 · 1 comentario · Abierto el 12/12/2024
How can we customize the color in the dotplot? I want to use the color from the darjeeling1 palette. Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#294 · 2 comentarios · Abierto el 23/9/2024
Ridgeplot Draws Empty Rows Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 42/100

YuLab-SMU/enrichplot#288 · 2 comentarios · Abierto el 21/8/2024
Textbook Lacks Important Details Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

YuLab-SMU/enrichplot#287 · Abierto el 20/8/2024
Textbook barplot Links to Wrong R Package Abierto

Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 55/100

YuLab-SMU/enrichplot#286 · Abierto el 20/8/2024
How to set range of p.adjust in dotplot? Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#285 · 2 comentarios · Abierto el 13/8/2024
Problem in cnetplot visualisation Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#284 · Abierto el 30/7/2024
how can i change the colour of category node of my own choice in cnetplot Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 10/100

YuLab-SMU/enrichplot#282 · 1 comentario · Abierto el 24/7/2024
change edge color in cnetplot Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#278 · 8 comentarios · Abierto el 4/7/2024
p.adjust value not being rounded in `dotplot` Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#277 · 1 comentario · Abierto el 6/6/2024
Use this package with Seurat? Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 15/100

YuLab-SMU/enrichplot#276 · 1 comentario · Abierto el 24/5/2024
gene name in cnetplot--with own GO annotation data Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 32/100

YuLab-SMU/enrichplot#275 · 2 comentarios · Abierto el 23/5/2024
How can I change the width of each coloum in the heatmap in the treeplot? Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#274 · 1 comentario · Abierto el 8/5/2024
compareCluster dotplot: how to modify the genesets order Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 40/100

YuLab-SMU/enrichplot#272 · 1 comentario · Abierto el 11/4/2024
unexpected change of default colors/theme with enrichplot Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#268 · 7 comentarios · Abierto el 24/1/2024
why does my treeplot only appear partially? Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#264 · 2 comentarios · Abierto el 6/12/2023
emapplot and cnetplot customization (compareCluster) Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 30/100

YuLab-SMU/enrichplot#261 · 5 comentarios · Abierto el 28/10/2023
show all nodes but show select labels in emapplot Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

YuLab-SMU/enrichplot#257 · 3 comentarios · Abierto el 1/10/2023
Upsetplot Question Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#252 · Abierto el 24/8/2023
Recolouring treeplot Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#250 · 1 comentario · Abierto el 30/7/2023
Error in offspring.tbl_tree_item(.data = .data, .node = .node, tiponly = tiponly, : could not find function "offspring.tbl_tree_item" Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#249 · 3 comentarios · 1 reacción · Abierto el 23/7/2023
R-4.3.1: could not find function "offspring.tbl_tree_item" Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 28/100

YuLab-SMU/enrichplot#247 · 5 comentarios · Abierto el 20/7/2023
为什么treeplot画出来的Go term,字体没有颜色 Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#246 · 3 comentarios · Abierto el 13/7/2023
How to implement treeplot to genes Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#241 · 4 comentarios · Abierto el 10/5/2023
Unable to alter any emapplot cluster parameters Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#240 · 1 comentario · Abierto el 5/5/2023
gseaplot2()函数中 pvalue_table = T的副产品：显示信号通路名（不想要它，如何去除？） Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#238 · 1 comentario · Abierto el 25/4/2023
Extract 1 term per cluster in TreePlot Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#237 · Abierto el 18/4/2023
treeplot not working Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#234 · 1 comentario · Abierto el 21/3/2023
How am I supposed to tell the function heatplot() the p-values? Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

YuLab-SMU/enrichplot#233 · 1 comentario · 1 reacción · Abierto el 14/3/2023
treeplot.compareClusterResult : dot and tree overlap Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#232 · 5 comentarios · Abierto el 13/3/2023
Getting NA as gene Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

YuLab-SMU/enrichplot#231 · 1 comentario · Abierto el 26/2/2023
dotplot cannot use pvalue to filter Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#230 · 1 comentario · Abierto el 21/2/2023
error using emapplot on compareCluster results wit all GO onotologies Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 30/100

YuLab-SMU/enrichplot#228 · 6 comentarios · Abierto el 17/2/2023
Ridgeplot - upload data from external GSEA search? Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 18/100

YuLab-SMU/enrichplot#227 · 1 comentario · Abierto el 16/2/2023
enrichplot::emapplot() : transparency dependent on q-value? Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#226 · Abierto el 10/2/2023
enrichplot::ridgeplot: fill="qvalue" does not work Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#225 · 1 comentario · Abierto el 8/2/2023
Error in treeplot Overlap between dotplot and dendogram treeplot geneClusterPanel = "dotplot" Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#224 · 3 comentarios · Abierto el 6/2/2023
Emapplot compareCluster : How to remove the legend of the number of genes per circle? Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#222 · 3 comentarios · Abierto el 2/2/2023
How to extract network (in cnetplot + emapplot) for export? Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 38/100

YuLab-SMU/enrichplot#220 · 4 comentarios · Abierto el 23/12/2022
Possible for adding the parameters to adjust the font in the cnetplot and emapplot? Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

YuLab-SMU/enrichplot#215 · Abierto el 29/11/2022
Treeplot: possible to add border color around tippoints for a feature/column in enrichResult? Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 38/100

YuLab-SMU/enrichplot#214 · 2 comentarios · Abierto el 23/11/2022
Plots that show circle size "Number of genes" should be "Gene Ratio" for gseaResult Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 48/100

YuLab-SMU/enrichplot#206 · Abierto el 27/10/2022
gseaplot2 pvalue_table Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

YuLab-SMU/enrichplot#203 · 2 comentarios · Abierto el 18/10/2022

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