Improve model abstractions
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評価
- 難易度
- 5/5
- 見積もり時間
- 1週間以上
- 初心者へのやさしさ
- 25/100
調査の方向性
Start by reading petab.v1.models.model.Model and the discussion in #517, including the linked pull request comment. Map how derived parameters and is_state_variable are used across the package before proposing changes. Done means the model abstraction reflects the constant, differential, and algebraic taxonomy without conflating simulator decisions.
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
The current model abstraction in petab.v1.models.model.Model isn't great. Non-exhaustive list of problems:
- We don't have proper handling of derived parameters (#517 / https://github.com/PEtab-dev/libpetab-python/pull/517#issuecomment-5566488336)
is_state_variableconflates different questions. The simulator decides what's treated as a state variable - that's none of PEtab's business.- Ideally, the library would more closely adopt the specs' taxonomy regarding constant, differential, and algebraic entities.
Improve that. This will probably impact quite a number of places and needs to be addressed carefully.
- 主要言語
- Python
- スター
- 18
- フォーク
- 9
- 平均マージ
- 2日 4時間
- マージ済み PR（30日）
- 30
環境構築
- Dockerfile・Docker Compose ファイルなし
- プルリクエストのテンプレートなし
- コントリビューションガイドを読む
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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