Filtering VCF by ranges
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評価
- 難易度
- 5/5
- 見積もり時間
- 1週間以上
- 初心者へのやさしさ
- 25/100
- issue の種類
- 機能追加
- 明瞭さ
- 説明が足りない
- 活発さ
- 停滞
- 技術スタック
- r
調査の方向性
まず filterVcf() と、issue で説明されている GenomicFiles の reduction approach を読みます。range-based iteration が incremental filtering および functional, side-effect-free processing とどのように連携すべきかを明確にします。完了条件には、yield count だけでフィルタリングするのではなく、合意された range-filtering の動作を含める必要があります。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
Would be useful to filter a VCF incrementally by range. Range-based iteration makes sense when e.g. removing duplicates. Right now filterVcf() only works by yield count. The GenomicFiles package makes reduction easier but not necessarily filtering at the file level. At least, side effects are undesirable in that functional framework.
- 主要言語
- R
- スター
- 32
- フォーク
- 21
- PR マージ指標
- 30日以内にマージされた PR はありません
コントリビューションガイド
このリポジトリのコントリビューションガイドは索引されていません
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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