Hacktoberfest 2026:メンテナが10月に向けて印を付けた、オープンで初心者向けの issue。 Hacktoberfest の issue を見る

DoparParam: Disable capturing of stdout?

オープン
#276 コメント 0 件 リアクション 0 件 担当者 0 名 GitHub で見る

まだ誰も着手していません。

評価

難易度
3/5
見積もり時間
1〜2日
初心者へのやさしさ
45/100
issue の種類
機能追加
明瞭さ
おおむね明確
活発さ
停滞
技術スタック
r

調査の方向性

Inspect R/DoparParam-class.R at the cited implementation and compare it with the sink.sout handling in R/SerialParam-class.R and R/worker.R. Determine how DoparParam could expose the option, then verify with the shown bplapply example that stdout is not captured when disabled.

索引モデルが issue の本文から書いたものです。

説明

Is it possible to disable capturing of stdout? Specifically, is there an option/argument I can pass such that the following output does not appear:

> library(BiocParallel)
> y <- bplapply(1:2, print, BPPARAM = BiocParallel::DoparParam())
[1] 1
[1] 2

?

I'm aware of capture.output() etc, but I want to prevent it from being captured in the first place.

I understand that .bpworker_EXEC() takes argument sink.sout;

https://github.com/Bioconductor/BiocParallel/blob/9e2db5de5f145509e494dd7668aefb2b82e6b21f/R/worker.R#L297-L298

but it looks like DoparParam does not allow me to pass that argument:

https://github.com/Bioconductor/BiocParallel/blob/9e2db5de5f145509e494dd7668aefb2b82e6b21f/R/DoparParam-class.R#L99

In contrast, it looks like SerialParam supports it:

https://github.com/Bioconductor/BiocParallel/blob/9e2db5de5f145509e494dd7668aefb2b82e6b21f/R/SerialParam-class.R#L150

If not supported right now, would you consider to add way to disable it?

主要言語
R
スター
69
フォーク
32
PR マージ指標
30日以内にマージされた PR はありません

コントリビューションガイド

このリポジトリのコントリビューションガイドは索引されていません

はじめの一歩

  1. issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
  2. 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
  3. リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
  4. issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。

Bioconductor/BiocParallel のほかの issue

Bioconductor/BiocParallel の issue をすべて見る

似ている issue

R の issue をもっと見る

新しい issue をメールで受け取る

初心者向けの GitHub issue を短くまとめたダイジェスト。