DoparParam: Disable capturing of stdout?
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评估
- 难度
- 3/5
- 预计耗时
- 1-2 天
- 新手友好度
- 45/100
- Issue 类型
- 功能
- 描述清晰度
- 基本清楚
- 活跃度
- 停滞
- 技术栈
- r
调研方向
Inspect R/DoparParam-class.R at the cited implementation and compare it with the sink.sout handling in R/SerialParam-class.R and R/worker.R. Determine how DoparParam could expose the option, then verify with the shown bplapply example that stdout is not captured when disabled.
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
Is it possible to disable capturing of stdout? Specifically, is there an option/argument I can pass such that the following output does not appear:
> library(BiocParallel)
> y <- bplapply(1:2, print, BPPARAM = BiocParallel::DoparParam())
[1] 1
[1] 2
?
I'm aware of capture.output() etc, but I want to prevent it from being captured in the first place.
I understand that .bpworker_EXEC() takes argument sink.sout;
but it looks like DoparParam does not allow me to pass that argument:
In contrast, it looks like SerialParam supports it:
If not supported right now, would you consider to add way to disable it?
- 主要语言
- R
- 星标
- 69
- 派生
- 32
- PR 合并指标
- 30 天内没有已合并 PR
环境准备
这个项目没有提供开发容器、Dockerfile 或贡献指南，环境需要你自己搭建：先看它的 README，通用步骤见我们的新手贡献指南。
从这里开始
- 先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
- Fork 仓库，在一个分支上完成修改。
- 提交 Pull Request，并在描述里引用这个 Issue 编号。
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