DoparParam: Captured stdout is relayed to stdout for some foreach adapters and stderr for others
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評価
- 難易度
- 4/5
- 見積もり時間
- 3〜5日
- 初心者へのやさしさ
- 35/100
- issue の種類
- バグ
- 明瞭さ
- おおむね明確
- 活発さ
- 停滞
- 技術スタック
- r
調査の方向性
Reproduce the issue using the shown registerDoSEQ() and registerDoParallel(2) examples with DoparParam(), then trace how captured output is relayed for each adapter. Done means print() output is consistently captured as stdout rather than stderr across the affected foreach adapters.
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
There is an inconsistency in how DoparParam() relays captured standard output. It appears to depend on which %dopar% adapter is registered.
For example,
> foreach::registerDoSEQ()
> out <- utils::capture.output(y <- BiocParallel::bplapply(1:2, print, BPPARAM = BiocParallel::DoparParam()), type = "output")
> out
[1] "[1] 1" "[1] 2"
relays the print() output to stdout, as expected.
But,
> doParallel::registerDoParallel(2)
> out <- utils::capture.output(y <- BiocParallel::bplapply(1:2, print, BPPARAM = BiocParallel::DoparParam()), type = "output")
[1] 1
[1] 2
> out <- utils::capture.output(y <- BiocParallel::bplapply(1:2, print, BPPARAM = BiocParallel::DoparParam()), type = "message")
> out
[1] "[1] 1" "[1] 2"
relays the print() output to stderr, which is not what one would expect from a print() call.
- 主要言語
- R
- スター
- 69
- フォーク
- 32
- PR マージ指標
- 30日以内にマージされた PR はありません
コントリビューションガイド
このリポジトリのコントリビューションガイドは索引されていません
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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