createTaxonTable - wide vs. narrow form
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Valutazione
- Difficoltà
- 3/5
- Tempo stimato
- 1-2 giorni
- Idoneità per principianti
- 38/100
Direzione di ricerca
Inizia individuando l’entry point createTaxonTable() e verifica come vengono assemblate le colonne attuali, incluse taxonomy, n_signatures e metaphlan name. Controlla come domain è rappresentato in taxonomy prima di decidere la struttura delle tabelle. Il lavoro è completato quando il formato Simple predefinito restituisce le colonne 1–6, mentre Full include le colonne taxonomy richieste e metaphlan name, con n_signatures risolto come specificato.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
Right now, createTaxonTable() outputs a very wide tibble with the entire taxonomy of the taxon presented as columns 7-13. This has some issues:
- It does not support domain which was added to the taxonomy so all the taxonomy is currently wrong
- It includes a column called "n_signatures" which I'm not sure what this means
- It also includes the metaphan name which feels unnecessary
Changes to this function should include:
- Remove n_signatures if it's not displaying anything useful
- Add an argument like "format = 'Full'/'Simple' " where full displays the full taxonomy columns and metaphlan name while simple only displays columns 1-6 and "Simple" is the default for that argument
- Lingua principale
- R
- Stelle
- 4
- Fork
- 18
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Preparare l'ambiente
Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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