createTaxonTable - wide vs. narrow form
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Evaluación
- Dificultad
- 3/5
- Tiempo estimado
- 1-2 días
- Aptitud para principiantes
- 38/100
Línea de trabajo
Comienza localizando el punto de entrada createTaxonTable() e inspecciona cómo se ensamblan actualmente sus columnas, incluyendo taxonomy, n_signatures y metaphlan name. Comprueba cómo se representa domain en taxonomy antes de decidir las formas de las tablas. Se considera terminado cuando el formato Simple predeterminado devuelve las columnas 1–6, mientras que Full incluye las columnas de taxonomy solicitadas y metaphlan name, con n_signatures resuelto según lo especificado.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
Right now, createTaxonTable() outputs a very wide tibble with the entire taxonomy of the taxon presented as columns 7-13. This has some issues:
- It does not support domain which was added to the taxonomy so all the taxonomy is currently wrong
- It includes a column called "n_signatures" which I'm not sure what this means
- It also includes the metaphan name which feels unnecessary
Changes to this function should include:
- Remove n_signatures if it's not displaying anything useful
- Add an argument like "format = 'Full'/'Simple' " where full displays the full taxonomy columns and metaphlan name while simple only displays columns 1-6 and "Simple" is the default for that argument
- Lenguaje dominante
- R
- Estrellas
- 4
- Forks
- 18
- Métricas de merge de PR
- Sin PR fusionados en 30 d
Preparar el entorno
Este proyecto no incluye contenedor de desarrollo, Dockerfile ni guía de contribución, así que la configuración corre por tu cuenta: empieza por su README y consulta nuestra guía para la primera contribución para los pasos generales.
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
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