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Create a gold standard example vignette

Aperta
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#45 1 commento 0 reazioni 1 assegnatario Vedi su GitHub

@fiddyhamma ci sta già lavorando.

Dal 1/7/2026.

Valutazione

Questa issue non è ancora stata valutata.

Descrizione

good first issue

Using a condition with plenty of signatures (i.e. at least 30), conduct a basic analysis of those signatures using the methods established in the other vignettes. This should include:

  1. Downloading the data from BugSigDB
  2. Filtering of the data to select relevant signatures and remove similar/duplicate signatures
  3. Description of the studies
  4. Description of the taxa
  5. Basic statistical tests
  6. Monte Carlo simulation to calculate critical N
  7. Heatmaps and dendrograms

Do not reinvent the wheel! Use existing functions in bugSigSimple and draw heavily on previously written vignettes.

Lingua principale
R
Stelle
4
Fork
18
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Preparare l'ambiente

Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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