Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

createTaxonTable - wide vs. narrow form

Đang mở
  • Có gì không ổn?
#28 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
3/5
Thời gian dự kiến
1-2 ngày
Mức phù hợp với người mới
38/100
Loại issue
Tính năng
Độ rõ ràng
Khá rõ ràng
Mức độ hoạt động
Đình trệ
Công nghệ
r
Lĩnh vực
data

Hướng nghiên cứu

Bắt đầu bằng cách xác định entry point createTaxonTable() và kiểm tra cách các cột hiện tại được ghép lại, bao gồm taxonomy, n_signatures và metaphlan name. Kiểm tra cách domain được biểu diễn trong taxonomy trước khi quyết định các dạng bảng. Công việc được xem là hoàn tất khi định dạng Simple mặc định trả về các cột 1–6, còn Full bao gồm các cột taxonomy được yêu cầu và metaphlan name, với n_signatures được phân giải như đã chỉ định.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

enhancement good first issue

Right now, createTaxonTable() outputs a very wide tibble with the entire taxonomy of the taxon presented as columns 7-13. This has some issues:

  • It does not support domain which was added to the taxonomy so all the taxonomy is currently wrong
  • It includes a column called "n_signatures" which I'm not sure what this means
  • It also includes the metaphan name which feels unnecessary

Changes to this function should include:

  • Remove n_signatures if it's not displaying anything useful
  • Add an argument like "format = 'Full'/'Simple' " where full displays the full taxonomy columns and metaphlan name while simple only displays columns 1-6 and "Simple" is the default for that argument
Ngôn ngữ chính
R
Star
4
Fork
18
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Chuẩn bị môi trường

Dự án này không cung cấp dev container, Dockerfile hay hướng dẫn đóng góp, nên bạn cần tự thiết lập môi trường: hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của waldronlab/bugSigSimple

Tất cả issue của waldronlab/bugSigSimple

Issue tương tự

Thêm issue về R

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.