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Update MACSima reader when stitching is supported

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#243 1 commento 1 reazione 0 assegnatari Vedi su GitHub

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Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
25/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Da chiarire
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
python
Ambito
data

Direzione di ricerca

Inizia esaminando il reader MACSima aggiunto nell’issue #224 e verificando il supporto attuale allo stitching in SpatialImage e SpatialData. Conferma che il lavoro sull’API da cui dipende sia completo prima di riesaminare il reader; per completo si intende che il reader supporti lo stitching e che la pipeline MCMICRO possa usare SpatialData per l’intero flusso.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

Talking with @m-albert at the ome-ngff hackathon, he has support for stitching using SpatialImage. We agreed to work together on adding the API for this in SpatialData. Once this work has been completed the MACSima reader as added with #224 should be revisited. This would also allow pipelines such as MCMICRO to use SpatialData throughout the pipeline. cc @kbestak

Lingua principale
Python
Stelle
103
Fork
65
Merge medio
1h 8m
PR unite (30g)
3

Preparare l'ambiente

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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