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Update MACSima reader when stitching is supported

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Evaluación

Dificultad
4/5
Tiempo estimado
3-5 días
Aptitud para principiantes
25/100
Tipo de issue
Nueva funcionalidad
Claridad
Necesita aclaración
Estado de actividad
Estancado
Stack tecnológico
python
Área
data

Línea de trabajo

Comienza revisando el lector MACSima añadido en el issue #224 y comprobando la compatibilidad actual con stitching en SpatialImage y SpatialData. Confirma que el trabajo de API del que depende está completo antes de volver a revisar el lector; se considera completado cuando el lector admite stitching y la canalización de MCMICRO puede usar SpatialData de principio a fin.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

Talking with @m-albert at the ome-ngff hackathon, he has support for stitching using SpatialImage. We agreed to work together on adding the API for this in SpatialData. Once this work has been completed the MACSima reader as added with #224 should be revisited. This would also allow pipelines such as MCMICRO to use SpatialData throughout the pipeline. cc @kbestak

Lenguaje dominante
Python
Estrellas
103
Forks
65
Merge medio
1 h 8 min
PR fusionados (30 d)
3

Preparar el entorno

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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