--webincli_mode validate will include study and co assembly sample regsitration
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Valutazione
- Difficoltà
- 3/5
- Tempo stimato
- 1-2 giorni
- Idoneità per principianti
- 55/100
- Tipo di issue
- Bug
- Chiarezza
- Abbastanza chiara
- Stato di attività
- Attiva
- Ambito
- backend-api-design
Direzione di ricerca
Start by tracing how --webincli_mode validate reaches REGISTER_COASSEMBLY_SAMPLE and REGISTERSTUDY, then check how test_upload controls submissions to the production server. Confirm whether validate mode can register real samples and study data, and verify that a dry run leaves no permanent ENA records.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
Description of the bug
--webincli_mode validate still registers real samples. REGISTER_COASSEMBLY_SAMPLE submits a virtual sample to the production server whenever test_upload is false, even in validate mode. So a dry run can create permanent ENA samples. Probably REGISTERSTUDY behaves the same way.
Command used and terminal output
Relevant files
No response
System information
No response
- Lingua principale
- Nextflow
- Stelle
- 22
- Fork
- 11
- Merge medio
- 1g 4h
- PR unite (30g)
- 8
Preparare l'ambiente
Avvia il container di sviluppo del progetto nel browser, con il tuo account GitHub.
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Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
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