Refactoring of FIND_CONCATENATE usage: replace with collectFile() operator

I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

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Come iniziare

1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

Altre issue di nf-core/seqsubmit

• --webincli_mode validate will include study and co assembly sample regsitration

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  bug

  Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 55/100

  nf-core/seqsubmit#118 · Aperta il 19/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• MultiQC skips assembly metadata table for co-assemblies (comma in quoted Runs field)

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  bug

  Difficoltà 3/5 Mezza giornata Idoneità per principianti 70/100

  nf-core/seqsubmit#115 · Aperta il 16/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• Long-read end-to-end submission

  Forse già presa @Vkale1 l’ha presa 12 giorni fa. Aperta

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  enhancement

  nf-core/seqsubmit#110 · 1 assegnatario · Aperta il 16/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• Allow single contig genomes to be submitted as chromosomes for long-reads

  Forse già presa @Vkale1 l’ha presa 12 giorni fa. Aperta

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  enhancement

  nf-core/seqsubmit#109 · 1 assegnatario · Aperta il 16/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• Support submission of MAGs/bins generated from co-assemblies

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  enhancement genome_submit

  Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 68/100

  nf-core/seqsubmit#96 · Aperta il 27/8/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

Tutte le issue di nf-core/seqsubmit

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  bug

  Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 78/100

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  Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 78/100

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  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

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  Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 72/100

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• Importer: an empty or non-numeric Error cell is imported as 0 instead of missing

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  Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 72/100

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  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

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