--webincli_mode validate will include study and co assembly sample regsitration
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Evaluación
- Dificultad
- 3/5
- Tiempo estimado
- 1-2 días
- Aptitud para principiantes
- 55/100
- Tipo de issue
- Error
- Claridad
- Bastante claro
- Estado de actividad
- Activo
- Área
- backend-api-design
Línea de trabajo
Start by tracing how --webincli_mode validate reaches REGISTER_COASSEMBLY_SAMPLE and REGISTERSTUDY, then check how test_upload controls submissions to the production server. Confirm whether validate mode can register real samples and study data, and verify that a dry run leaves no permanent ENA records.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
Description of the bug
--webincli_mode validate still registers real samples. REGISTER_COASSEMBLY_SAMPLE submits a virtual sample to the production server whenever test_upload is false, even in validate mode. So a dry run can create permanent ENA samples. Probably REGISTERSTUDY behaves the same way.
Command used and terminal output
Relevant files
No response
System information
No response
- Lenguaje dominante
- Nextflow
- Estrellas
- 22
- Forks
- 11
- Merge medio
- 1 d 4 h
- PR fusionados (30 d)
- 8
Preparar el entorno
Inicia el contenedor de desarrollo del proyecto en tu navegador, con tu propia cuenta de GitHub.
- Sin Dockerfile ni archivo de Docker Compose
- Tiene una plantilla de pull request
- Leer la guía de contribución
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
Más de nf-core/seqsubmit
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bug
Dificultad 3/5 Medio día Aptitud para principiantes 70/100
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Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 42/100
nf-core/seqsubmit#98 · 1 asignado ·
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enhancement
Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100
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Todos los issues de nf-core/seqsubmit
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