Change simple fasq_align_{aligner} subworkflows to fastq_align_dna
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评估
- 难度
- 4/5
- 预计耗时
- 3-5 天
- 新手友好度
- 35/100
- Issue 类型
- 重构
- 描述清晰度
- 需要澄清
- 活跃度
- 冷清
调研方向
首先检查 fastq_align_{aligner} 和 fastq_align_dna 子工作流，然后阅读所引用的 nf-core/modules issue #11075。确定应如何添加 chromap，并解决围绕 star 的未决设计问题。当迁移计划及由此产生的子工作流更改达成一致并完成实现后，即视为完成。
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
Potentially we should switch from the individual fastq_align_{aligner} subworkflows to fastq_align_dna.
For reference see here: https://github.com/nf-core/modules/issues/11075
Potential to dos:
- Adding
chromaptofastq_align_dna - How do we want to deal with
star, we would need to discuss that.
- 主要语言
- Nextflow
- 星标
- 245
- 派生
- 184
- 平均合并
- 6 分钟
- 30 天内合并 PR
- 1
环境准备
在浏览器里用你自己的 GitHub 账号启动这个项目的开发容器。
- 没有 Dockerfile 或 Docker Compose 文件
- 有 Pull Request 模板
- 阅读贡献指南
从这里开始
- 先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
- Fork 仓库，在一个分支上完成修改。
- 提交 Pull Request，并在描述里引用这个 Issue 编号。
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