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mskcc
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vcf2maf
Convert a VCF into a MAF, where each variant is annotated to only one of all possible gene isoforms
Perl · 421 stelle
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Computational Biology Summer Program Hackathon
Jupyter Notebook · 14 stelle
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NeoQual-nf
Pipeline for computing neoantigen qualities from DNA and RNA-Seq data
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Sapio LIMS customizations to workflows for IGO
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igo-sample-submission-node
Sample Submission API written in node.js
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 15/100
mskcc/smile-server#2005 ·
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ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100
mskcc/smile-server#2004 ·
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ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 38/100
mskcc/smile-server#2003 · 1 commento ·
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DocumentationApertaASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100
mskcc/smile-server#2002 · 1 commento ·
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ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100
mskcc/smile-server#2001 · 1 commento ·
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MSK-IMPACT 50k validationApertaASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 38/100
mskcc/smile-server#2000 · 1 commento ·
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ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 15/100
mskcc/smile-server#1999 ·
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ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100
mskcc/smile-server#1998 · 1 commento ·
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ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100
mskcc/smile-server#1997 · 1 commento ·
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ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 56/100
mskcc/smile-server#1996 · 1 commento ·
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ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100
mskcc/smile-server#1995 · 1 commento ·
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ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100
mskcc/smile-server#1994 · 1 commento ·
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ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100
mskcc/smile-server#1993 · 1 commento ·
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ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100
mskcc/smile-server#1992 · 1 commento ·
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ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100
mskcc/smile-server#1991 · 1 commento ·
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ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 64/100
mskcc/smile-server#1990 · 1 commento ·
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ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100
mskcc/smile-server#1989 · 1 commento ·
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ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100
mskcc/smile-server#1988 · 1 commento ·
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ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100
mskcc/smile-server#1987 · 1 commento ·
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ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 63/100
mskcc/smile-server#1986 · 1 commento ·
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ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100
mskcc/smile-server#1985 · 1 commento ·
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ASCN cBioPortal frontendApertaASCN/cBioPortal Dashboard Development
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100
mskcc/smile-server#1984 ·
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ASCN for cBioPortalAperta
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100
mskcc/smile-server#1983 ·
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100
mskcc/smile-server#1982 ·
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Clinical Data Integration SMILE Server Development
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100
mskcc/smile-server#1981 · 1 commento ·
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Migrate dev database or make available a dev instance of the cbio db with ASCN supported changesApertaASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100
mskcc/smile-server#1979 · 1 commento ·
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ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100
mskcc/smile-server#1978 · 1 commento ·
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ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100
mskcc/smile-server#1977 · 1 commento ·
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ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 20/100
mskcc/smile-server#1976 · 1 commento ·
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ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100
mskcc/smile-server#1975 · 1 commento ·
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ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100
mskcc/smile-server#1974 · 1 commento ·
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ASCN/FACETSApertaASCN/cBioPortal Epic Pipelines/cBioPortal
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 15/100
mskcc/smile-server#1973 ·
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Dashboard Development
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 72/100
mskcc/smile-server#1972 · 1 commento ·
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Dashboard Development
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 65/100
mskcc/smile-server#1971 ·
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Dashboard Development
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100
mskcc/smile-server#1970 · 1 commento ·
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Update node version to latest compatible version of modules we need (graphql, neo4j, dbx, nats)ApertaDashboard Development
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 55/100
mskcc/smile-server#1969 · 1 commento ·
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ASCN cBioPortal backendApertaEpic Pipelines/cBioPortal TEMPO-cBio Pipeline
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100
mskcc/smile-server#1968 ·
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 10/100
mskcc/smile-server#1967 ·
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Databricks Pipelines/cBioPortal TEMPO Cohort Building
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100
mskcc/smile-server#1966 ·
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Dashboard Development
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100
mskcc/smile-server#1965 ·
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100
mskcc/smile-server#1941 ·
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100
mskcc/smile-server#1939 ·
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Dashboard Development Epic SMILE Server Development
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
mskcc/smile-server#1933 ·
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Microbiome
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 20/100
mskcc/smile-server#1915 ·
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Dashboard Development enhancement Epic SMILE Server Development TEMPO Cohort Building
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100
mskcc/smile-server#1903 ·
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Fingerprinting follow up with WES samples that have mismatching DMP patient IDs/CMO patient IDsApertaData Request
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 28/100
mskcc/smile-server#1900 ·
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100
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SMILE-TEMPO pipelineAperta
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 10/100
mskcc/smile-server#1880 ·
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