Hacktoberfest 2026: die Issues, die Maintainer für den Oktober markiert haben – offen und einsteigerfreundlich. Hacktoberfest-Issues durchsuchen

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  • PR to address request-level only checks in request-filter
    Offen

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 15/100

    mskcc/smile-server#2005 ·

  • Update facets* data files to ascn files in TEMPO WES cohort
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

    mskcc/smile-server#2004 ·

  • Production deployment and monitoring
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 38/100

    mskcc/smile-server#2003 ·

  • Documentation
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100

    mskcc/smile-server#2002 ·

  • cross-browser and accessibility QA
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    mskcc/smile-server#2001 ·

  • MSK-IMPACT 50k validation
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 38/100

    mskcc/smile-server#2000 ·

  • ASCN integration, testing, launch
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 15/100

    mskcc/smile-server#1999 ·

  • e2e integration with backend
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    mskcc/smile-server#1998 ·

  • Patient View - ASCN genome browser track
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100

    mskcc/smile-server#1997 ·

  • Study-level ASCN availability indicator
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 56/100

    mskcc/smile-server#1996 ·

  • ASCN download/export
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100

    mskcc/smile-server#1995 ·

  • ASCN cohort heatmap (results view)
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    mskcc/smile-server#1994 ·

  • Example study and integration tests
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100

    mskcc/smile-server#1993 ·

  • REST API endpoints in main cbioportal repo
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100

    mskcc/smile-server#1992 ·

  • Validator support (main cbioportal repo)
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100

    mskcc/smile-server#1991 ·

  • Python importer wiring (cbioportla-core: cbioportal_common.py)
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 64/100

    mskcc/smile-server#1990 ·

  • Confirm ClickHouseBulkLoader and ClickHouseAutoIncrement can serve the new tables without code changes (table names are parameterized)
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

    mskcc/smile-server#1989 ·

  • Update test resource clickhouse_cgds_.sql to match finalized schema
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    mskcc/smile-server#1988 ·

  • ClickHouse db migration that creates ascn_seg and ascn_gene_level* tables
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

    mskcc/smile-server#1987 ·

  • TCN/LCN integer constraint documented, log warnings
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 63/100

    mskcc/smile-server#1986 ·

  • ASCN schema and naming alignment
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    mskcc/smile-server#1985 ·

  • ASCN cBioPortal frontend
    Offen
    ASCN/cBioPortal Dashboard Development

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100

    mskcc/smile-server#1984 ·

  • ASCN for cBioPortal
    Offen

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 20/100

    mskcc/smile-server#1983 ·

  • dbx pipeline for importing select smile data
    Offen

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 20/100

    mskcc/smile-server#1982 ·

  • Allow clinical samples to import into SMILE without required CMO patient ID mapping
    Offen
    Clinical Data Integration SMILE Server Development

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

    mskcc/smile-server#1981 ·

  • documented support of ASCN in cbio docs, etc. (identify all sources for updates)
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    mskcc/smile-server#1980 ·

  • Migrate dev database or make available a dev instance of the cbio db with ASCN supported changes
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 30/100

    mskcc/smile-server#1979 ·

  • [cbio-core] API endpoints for ASCN supported
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 20/100

    mskcc/smile-server#1978 ·

  • [cbio-frontend] ASCN tab visualization with toggle for LOH-focused and gain-focused views
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 20/100

    mskcc/smile-server#1977 ·

  • [cbio-core] validator, tests working for ASCN import
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 20/100

    mskcc/smile-server#1976 ·

  • [cbio-core] db schema, models, dao, importer support for ASCN
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 20/100

    mskcc/smile-server#1975 ·

  • RFC finalization and IQ resolution
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 20/100

    mskcc/smile-server#1974 ·

  • ASCN/FACETS
    Offen
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 15/100

    mskcc/smile-server#1973 ·

  • [dashboard] import only ag-grid-enterprise modules needed
    Offen
    Dashboard Development

    Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 72/100

    mskcc/smile-server#1972 ·

  • [dashboard] address slow startup time
    Offen
    Dashboard Development

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 65/100

    mskcc/smile-server#1971 ·

  • [worth exploring] implement a small in-flight Map<query, Promise> for caching arbitrary queries for a short time (15 min)
    Offen

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    mskcc/smile-server#1970 ·

  • Update node version to latest compatible version of modules we need (graphql, neo4j, dbx, nats)
    Offen
    Dashboard Development

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100

    mskcc/smile-server#1969 ·

  • ASCN cBioPortal backend
    Offen
    Epic Pipelines/cBioPortal TEMPO-cBio Pipeline

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 20/100

    mskcc/smile-server#1968 ·

  • ASCN start general roadmap of work (and capture in scrum cards)
    Offen

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 10/100

    mskcc/smile-server#1967 ·

  • dbx pipeline for compiling candidate samples for MSKWESRP
    Offen
    Databricks Pipelines/cBioPortal TEMPO Cohort Building

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 20/100

    mskcc/smile-server#1966 ·

  • [dashboard] implement method for viewing latest report of candidate MSKWESRP samples
    Offen
    Dashboard Development

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100

    mskcc/smile-server#1965 ·

  • FACETS schema changes for cbioportal
    Offen

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

    mskcc/smile-server#1941 ·

  • FACETS schema changes for cbioportal
    Offen

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 30/100

    mskcc/smile-server#1939 ·

  • Multiplex Samples Support in SMILE
    Offen
    Dashboard Development Epic SMILE Server Development

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

    mskcc/smile-server#1933 ·

  • Schema updates for microbiome support
    Offen
    Microbiome

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 20/100

    mskcc/smile-server#1915 ·

  • Identification of MSKWESRP candidate samples
    Offen
    Dashboard Development enhancement Epic SMILE Server Development TEMPO Cohort Building

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 30/100

    mskcc/smile-server#1903 ·

  • Fingerprinting follow up with WES samples that have mismatching DMP patient IDs/CMO patient IDs
    Offen
    Data Request

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 28/100

    mskcc/smile-server#1900 ·

  • vcf2maf failing to populated CAADD, REVEL, MutationTaster, Polyphenscores
    Offen

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    mskcc/vcf2maf#381 ·

  • cbioportal importer support - db schema updates to support new visualizations
    Offen
    TEMPO-cBio Pipeline

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

    mskcc/smile-server#1883 ·

  • SMILE-TEMPO pipeline
    Offen

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 10/100

    mskcc/smile-server#1880 ·

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