Hacktoberfest 2026: as issues que os mantenedores marcaram para outubro, abertas e boas para iniciantes. Ver issues do Hacktoberfest

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mskcc

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Para iniciantes Tudo
Abertas Todas

Issues em que talvez alguém já esteja trabalhando aparecem no fim. Ordenar tudo por data

  • Production deployment and monitoring
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 38/100

    mskcc/smile-server#2003 ·

  • Documentation
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 48/100

    mskcc/smile-server#2002 ·

  • cross-browser and accessibility QA
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    mskcc/smile-server#2001 ·

  • MSK-IMPACT 50k validation
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 38/100

    mskcc/smile-server#2000 ·

  • ASCN integration, testing, launch
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 15/100

    mskcc/smile-server#1999 ·

  • e2e integration with backend
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 45/100

    mskcc/smile-server#1998 ·

  • Patient View - ASCN genome browser track
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 48/100

    mskcc/smile-server#1997 ·

  • Study-level ASCN availability indicator
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 56/100

    mskcc/smile-server#1996 ·

  • ASCN download/export
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 48/100

    mskcc/smile-server#1995 ·

  • ASCN cohort heatmap (results view)
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 45/100

    mskcc/smile-server#1994 ·

  • Example study and integration tests
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 48/100

    mskcc/smile-server#1993 ·

  • REST API endpoints in main cbioportal repo
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 48/100

    mskcc/smile-server#1992 ·

  • Validator support (main cbioportal repo)
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 48/100

    mskcc/smile-server#1991 ·

  • Python importer wiring (cbioportla-core: cbioportal_common.py)
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 64/100

    mskcc/smile-server#1990 ·

  • Confirm ClickHouseBulkLoader and ClickHouseAutoIncrement can serve the new tables without code changes (table names are parameterized)
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

    mskcc/smile-server#1989 ·

  • Update test resource clickhouse_cgds_.sql to match finalized schema
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    mskcc/smile-server#1988 ·

  • ClickHouse db migration that creates ascn_seg and ascn_gene_level* tables
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

    mskcc/smile-server#1987 ·

  • TCN/LCN integer constraint documented, log warnings
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 63/100

    mskcc/smile-server#1986 ·

  • ASCN schema and naming alignment
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 45/100

    mskcc/smile-server#1985 ·

  • ASCN cBioPortal frontend
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Dashboard Development

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 35/100

    mskcc/smile-server#1984 ·

  • ASCN for cBioPortal
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 20/100

    mskcc/smile-server#1983 ·

  • dbx pipeline for importing select smile data
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 20/100

    mskcc/smile-server#1982 ·

  • Allow clinical samples to import into SMILE without required CMO patient ID mapping
    Aberta
    • Algo errado?
    Clinical Data Integration SMILE Server Development

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

    mskcc/smile-server#1981 ·

  • documented support of ASCN in cbio docs, etc. (identify all sources for updates)
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    mskcc/smile-server#1980 ·

  • Migrate dev database or make available a dev instance of the cbio db with ASCN supported changes
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 30/100

    mskcc/smile-server#1979 ·

  • [cbio-core] API endpoints for ASCN supported
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 20/100

    mskcc/smile-server#1978 ·

  • [cbio-frontend] ASCN tab visualization with toggle for LOH-focused and gain-focused views
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 20/100

    mskcc/smile-server#1977 ·

  • [cbio-core] validator, tests working for ASCN import
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 20/100

    mskcc/smile-server#1976 ·

  • [cbio-core] db schema, models, dao, importer support for ASCN
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 20/100

    mskcc/smile-server#1975 ·

  • RFC finalization and IQ resolution
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 20/100

    mskcc/smile-server#1974 ·

  • ASCN/FACETS
    Aberta
    • Algo errado?
    ASCN/cBioPortal Pipelines/cBioPortal

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 15/100

    mskcc/smile-server#1973 ·

  • [dashboard] import only ag-grid-enterprise modules needed
    Aberta
    • Algo errado?
    Dashboard Development

    Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 72/100

    mskcc/smile-server#1972 ·

  • [dashboard] address slow startup time
    Aberta
    • Algo errado?
    Dashboard Development

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 65/100

    mskcc/smile-server#1971 ·

  • [worth exploring] implement a small in-flight Map<query, Promise> for caching arbitrary queries for a short time (15 min)
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    mskcc/smile-server#1970 ·

  • Update node version to latest compatible version of modules we need (graphql, neo4j, dbx, nats)
    Aberta
    • Algo errado?
    Dashboard Development

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 55/100

    mskcc/smile-server#1969 ·

  • ASCN cBioPortal backend
    Aberta
    • Algo errado?
    Epic Pipelines/cBioPortal TEMPO-cBio Pipeline

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 20/100

    mskcc/smile-server#1968 ·

  • ASCN start general roadmap of work (and capture in scrum cards)
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 10/100

    mskcc/smile-server#1967 ·

  • dbx pipeline for compiling candidate samples for MSKWESRP
    Aberta
    • Algo errado?
    Databricks Pipelines/cBioPortal TEMPO Cohort Building

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 20/100

    mskcc/smile-server#1966 ·

  • [dashboard] implement method for viewing latest report of candidate MSKWESRP samples
    Aberta
    • Algo errado?
    Dashboard Development

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 48/100

    mskcc/smile-server#1965 ·

  • FACETS schema changes for cbioportal
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

    mskcc/smile-server#1941 ·

  • FACETS schema changes for cbioportal
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 30/100

    mskcc/smile-server#1939 ·

  • Multiplex Samples Support in SMILE
    Aberta
    • Algo errado?
    Dashboard Development Epic SMILE Server Development

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 25/100

    mskcc/smile-server#1933 ·

  • Schema updates for microbiome support
    Aberta
    • Algo errado?
    Microbiome

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 20/100

    mskcc/smile-server#1915 ·

  • Identification of MSKWESRP candidate samples
    Aberta
    • Algo errado?
    Dashboard Development enhancement Epic SMILE Server Development TEMPO Cohort Building

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 30/100

    mskcc/smile-server#1903 ·

  • Fingerprinting follow up with WES samples that have mismatching DMP patient IDs/CMO patient IDs
    Aberta
    • Algo errado?
    Data Request

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 28/100

    mskcc/smile-server#1900 ·

  • vcf2maf failing to populated CAADD, REVEL, MutationTaster, Polyphenscores
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    mskcc/vcf2maf#381 ·

  • cbioportal importer support - db schema updates to support new visualizations
    Aberta
    • Algo errado?
    TEMPO-cBio Pipeline

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 25/100

    mskcc/smile-server#1883 ·

  • SMILE-TEMPO pipeline
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 10/100

    mskcc/smile-server#1880 ·

  • TEMPO-cBio Pipeline
    Aberta
    • Algo errado?
    Epic TEMPO-cBio Pipeline

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 25/100

    mskcc/smile-server#1877 ·

  • Command line inputs of phylowgs parameters fail due to wrong typing
    Aberta
    • Algo errado?
    bug

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 55/100

    mskcc/NeoQual-nf#96 ·

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