Hacktoberfest 2026: le issue che i maintainer hanno segnato per ottobre, aperte e adatte ai principianti. Sfoglia le issue Hacktoberfest

mskcc/beagle

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Voyager Backend

mskcc/beagle è adatto ai principianti?

I maintainer di mskcc/beagle di solito rispondono a una pull request entro 3 giorni. In questo momento è aperta 1 issue adatta ai principianti.

Stelle
2
Fork
7
Issue aperte per principianti
1
Issue indicizzate
99
Merge medio
3g 15h
PR unite (30g)
7
Lingua principale
Python
Licenza
Apache-2.0
Ultimo push su GitHub
25/9/2026
Ultima indicizzazione
19/9/2026
Nessuna guida per i contributori
Nessun codice di condotta
Label per principianti
help wanted

Come contribuire a mskcc/beagle

  1. Non c'è una guida per contribuire: parti dal README e da alcune pull request accettate di recente per capire come si propongono le modifiche.
  2. Include un Dockerfile o un file Docker Compose, quindi puoi avviarlo senza installare tutta la sua toolchain.
  3. I tuoi contributi saranno pubblicati con la licenza Apache-2.0 del progetto.
  4. Scegli la issue aperta adatta ai principianti qui sotto e, prima di iniziare, scrivi in un commento che vuoi occupartene.
Adatte ai principianti Tutto
Aperta Tutte

Le issue su cui forse qualcuno sta già lavorando sono in fondo alla lista. Ordina tutto per data

  • Remove all harded references to juno
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 68/100

    mskcc/beagle#1500 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • How will strict syntax affect repo
    Forse di nuovo libera Aperta
    • Qualcosa non va?

    mskcc/beagle#1493 · 1 assegnatario ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Update mock metadata
    Forse di nuovo libera Aperta
    • Qualcosa non va?

    mskcc/beagle#1125 · 1 assegnatario ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Cannot logout of admin on swagger page
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    bug

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 35/100

    mskcc/beagle#1122 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • tempo-mpgen column names inconsistent with schema
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

    mskcc/beagle#1068 · 1 commento ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Operator errors are hidden in the logs
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

    mskcc/beagle#1058 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Approved users does not populate the user model
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    bug

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

    mskcc/beagle#1053 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Cannot log out as admin
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    bug

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 25/100

    mskcc/beagle#1052 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Replace User Specific Paths on Jinja Template
    Forse di nuovo libera Aperta
    • Qualcosa non va?

    mskcc/beagle#1034 · 1 assegnatario ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Github Repo page for Tempo
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 25/100

    mskcc/beagle#1030 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Need to updated paths
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 45/100

    mskcc/beagle#1028 · 1 commento ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • checking if historical pairing file was de-synced
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

    mskcc/beagle#996 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Check isCmoRequest flag on import
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 25/100

    mskcc/beagle#987 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Jobs restarted through the retry endpoint start with resume_attempts 0
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    bug

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 35/100

    mskcc/beagle#984 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Job restart failed to submit if job_store is cleaned up
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 20/100

    mskcc/beagle#963 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Notifier search does not search on status
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

    mskcc/beagle#939 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Modified_date should have db_index=true
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 35/100

    mskcc/beagle#929 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Queries on created_date do not work
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    bug

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 15/100

    mskcc/beagle#928 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Add migration to backfill jira ids to jobgroups
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 25/100

    mskcc/beagle#927 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Need to backfill deliveryDate metadata on empty fields
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 20/100

    mskcc/beagle#926 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Many of the jobgroup jira_id fields are empy
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    bug

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

    mskcc/beagle#925 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Handle JIRA status when 0 samples are imported
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 25/100

    mskcc/beagle#924 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Number of runs that complete differs from the number of runs that succeeded in OperatorRun
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    bug

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

    mskcc/beagle#920 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Some pooled normal fastq files show up twice in the mapping file
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 30/100

    mskcc/beagle#917 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Elastic apm configuration parameters should be set through env
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 38/100

    mskcc/beagle#915 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Assign study id(s) to sample metadata, IMPACT/HemePACT data sets mostly
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

    mskcc/beagle#891 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Refactor runner/tasks to work with abstract RunObjects in order to support Nextflow
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100

    mskcc/beagle#888 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • [MetaDB] Separate NATS job into different queue
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

    mskcc/beagle#887 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • [MetaDB] - Change deploy script to start NATS listening job
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

    mskcc/beagle#886 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Update helix filters operator output directory
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

    mskcc/beagle#885 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Argos operator - need to fix pairing with pooled normals through /v0/run/operator/pairs
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    bug

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    mskcc/beagle#884 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Missing conflict reasons
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

    mskcc/beagle#880 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • filter_redact=True behavior inconsistent; what is expected behavior
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 20/100

    mskcc/beagle#877 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Restarting jobs with updates to inputs
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

    mskcc/beagle#875 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Standardize logging for Celery tasks
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

    mskcc/beagle#863 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Hiseq Rapid Run and Hiseq High Output conflict
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    mskcc/beagle#854 · 4 commenti ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • For ETL, assign dirs, subdirs, and files being moved to CMO storage space to group cmoigo
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

    mskcc/beagle#846 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Add PipelineType
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 35/100

    mskcc/beagle#843 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Pipeline Completed before all runs are completed
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    mskcc/beagle#833 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Fix started time for runs
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 10/100

    mskcc/beagle#826 · 1 commento ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Job notification when an operator receives bad inputs errors out
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 55/100

    mskcc/beagle#821 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Deployment strategy for Voyager
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 15/100

    mskcc/beagle#820 · 1 commento ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Updated metadata JSON from beagle_etl sometimes don't output all json files into directory
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    mskcc/beagle#806 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Use Batch call to get Status of Job from Ridgeback
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

    mskcc/beagle#803 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Put work dir, lsf.log, input.json paths in Jira comments
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

    mskcc/beagle#801 · 1 commento ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Regex query does not seem to be working
    Forse di nuovo libera Aperta
    • Qualcosa non va?

    mskcc/beagle#786 · 1 assegnatario ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • parallelize access operators
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

    mskcc/beagle#785 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Index table and endpoint for autocomplete
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

    mskcc/beagle#777 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Value queries on the same field should be treated as OR queries
    Forse di nuovo libera Aperta
    • Qualcosa non va?

    mskcc/beagle#775 · 3 commenti · 1 assegnatario ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

  • Configure LSF walltime per Run
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

    mskcc/beagle#742 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni

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