Collect minor spec inconsistencies and clean-ups for the next PEtab version
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Valutazione
- Difficoltà
- 4/5
- Tempo stimato
- 1-2 giorni
- Idoneità per principianti
- 20/100
- Tipo di issue
- Documentazione
- Chiarezza
- Da chiarire
- Stato di attività
- Attiva
- Stack tecnologico
- yaml
- Ambito
- documentation
Direzione di ricerca
This is a design question, not a code change. Start with the problem YAML section of the PEtab v2 specification and the schema it references, and check how optional entries such as condition_files, experiment_files, mapping_files, extensions and id are described. Decide whether empty values should be valid for all optional entries, none, or only some, and whether the spec should recommend omitting unused entries. Done means the maintainers have recorded a decision on the thread.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
This issue collects small inconsistencies and clean-ups in the PEtab v2 specification. None of them warrant a change on their own, but they could be handled in the next version. Please add further items as comments.
- Empty values for optional problem YAML entries: The optional file lists (
condition_files,experiment_files,mapping_files) andextensionsmay be present but empty ([],{}). The optionalidcan't be empty (id: ""andid:fail the schema); it can only be left out. It's worth deciding whether empty values should be valid for all optional entries or for none, and whether the specification should recommend leaving out unused optional entries. (Came up in PEtab-dev/libpetab-python#547.)
🤖 Drafted with AI assistance (Claude Code)
- Lingua principale
- Nessun dato sulla lingua
- Stelle
- 67
- Fork
- 16
- Merge medio
- 1g 19h
- PR unite (30g)
- 1
Preparare l'ambiente
- Nessun Dockerfile né file Docker Compose
- Nessun modello di pull request
- Leggi la guida per i contributori
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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