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Collect minor spec inconsistencies and clean-ups for the next PEtab version

Ouverte
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Évaluation

Difficulté
4/5
Temps estimé
1-2 jours
Accessibilité débutants
20/100
Type d'issue
Documentation
Clarté
À clarifier
Activité
Active
Stack technique
yaml
Domaine
documentation

Piste de recherche

This is a design question, not a code change. Start with the problem YAML section of the PEtab v2 specification and the schema it references, and check how optional entries such as condition_files, experiment_files, mapping_files, extensions and id are described. Decide whether empty values should be valid for all optional entries, none, or only some, and whether the spec should recommend omitting unused entries. Done means the maintainers have recorded a decision on the thread.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Description

v2

This issue collects small inconsistencies and clean-ups in the PEtab v2 specification. None of them warrant a change on their own, but they could be handled in the next version. Please add further items as comments.

  • Empty values for optional problem YAML entries: The optional file lists (condition_files, experiment_files, mapping_files) and extensions may be present but empty ([], {}). The optional id can't be empty (id: "" and id: fail the schema); it can only be left out. It's worth deciding whether empty values should be valid for all optional entries or for none, and whether the specification should recommend leaving out unused optional entries. (Came up in PEtab-dev/libpetab-python#547.)

🤖 Drafted with AI assistance (Claude Code)

Langage dominant
Aucune donnée de langage
Étoiles
67
Forks
16
Merge moyen
1 j 19 h
PR mergées (30 j)
1

Préparer son environnement

Par où commencer

  1. Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
  2. Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
  3. Forkez le dépôt et travaillez sur une branche.
  4. Ouvrez une pull request qui référence le numéro de l'issue.

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