min.ff upstream 22ebd627 drops the per-k tminff files GROMACS Prepare's mineral list reads
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Valutazione
- Difficoltà
- 4/5
- Tempo stimato
- 3-5 giorni
- Idoneità per principianti
- 45/100
Direzione di ricerca
Start with scripts/minff_topology.py, especially list_minerals() and tminff_file(), then compare the min.ff layouts at 22ebd627 and d12b895 to find where the per-mineral k parameters moved. Run tests/minff to confirm the FileNotFoundError is resolved, and check that the updated min.ff bundle matches the new layout.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
Release check for 9.4.3: the newest min.ff (mholmboe/minff main, 22ebd627, 2026-10-15) has no ffnonbonded_tminff_k.itp files (and drops Alternative_* and ffnonbonded_tminff_all_k_sorted_by_mineral.itp; adds ffbonded_gminff.itp, ffbonded_tminff.itp). scripts/minff_topology.py list_minerals() opens tminff_file(ffdir, k) and fails with FileNotFoundError, so tests/minff fails. 9.4.3 keeps min.ff at d12b895 (19 commits behind) and ships atomipy 1.1. To do: read the new layout (where the per-mineral k parameters went) and update minff_topology.py, then bundle the new min.ff.
- Lingua principale
- C
- Stelle
- 10
- Fork
- 8
- Merge medio
- 1h 58m
- PR unite (30g)
- 8
Preparare l'ambiente
Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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