min.ff upstream 22ebd627 drops the per-k tminff files GROMACS Prepare's mineral list reads
Dieses Issue hat noch niemand übernommen.
Bewertung
- Schwierigkeit
- 4/5
- Geschätzter Aufwand
- 3-5 Tage
- Anfängerfreundlichkeit
- 45/100
Rechercherichtung
Start with scripts/minff_topology.py, especially list_minerals() and tminff_file(), then compare the min.ff layouts at 22ebd627 and d12b895 to find where the per-mineral k parameters moved. Run tests/minff to confirm the FileNotFoundError is resolved, and check that the updated min.ff bundle matches the new layout.
Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.
Beschreibung
Release check for 9.4.3: the newest min.ff (mholmboe/minff main, 22ebd627, 2026-10-15) has no ffnonbonded_tminff_k.itp files (and drops Alternative_* and ffnonbonded_tminff_all_k_sorted_by_mineral.itp; adds ffbonded_gminff.itp, ffbonded_tminff.itp). scripts/minff_topology.py list_minerals() opens tminff_file(ffdir, k) and fails with FileNotFoundError, so tests/minff fails. 9.4.3 keeps min.ff at d12b895 (19 commits behind) and ships atomipy 1.1. To do: read the new layout (where the per-mineral k parameters went) and update minff_topology.py, then bundle the new min.ff.
- Vorherrschende Sprache
- C
- Sterne
- 10
- Forks
- 8
- Ø Merge
- 1 Std. 58 Min.
- Gemergte PRs (30 T.)
- 8
Entwicklungsumgebung
Dieses Projekt bietet weder Dev-Container noch Dockerfile noch Beitragsleitfaden – die Einrichtung liegt bei Ihnen. Beginnen Sie mit der README; die allgemeinen Schritte stehen in unserem Leitfaden für den ersten Beitrag.
Erste Schritte
- Lesen Sie das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
- Schreiben Sie ins Issue, dass Sie es übernehmen — das erspart doppelte Arbeit.
- Forken Sie das Repository und arbeiten Sie in einem Branch.
- Öffnen Sie einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.
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