Add voltage collages to BluePyMM

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Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
35/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
python
Ambito
backend, data-visualization

Direzione di ricerca

Non viene indicato alcun file o test. Inizia tracciando il workflow BluePyMM che genera le tracce di tensione delle cellule campione, quindi determina dove è possibile aggiungere la reiniezione delle correnti di soglia e di mantenimento e come devono essere prodotti i collage. Il lavoro è completato quando gli output rappresentativi della neocorteccia possono essere esaminati visivamente per individuare errori e artefatti di eFEL.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

We should add a step that generates voltage collages of the traces generated by a sample of the cells.

E.g. for neocortex it would be useful to reinject the threshold / holding current in the cells and plot the output.

This way a human can check if everything is working correctly. (and if e.g. eFEL is not creating any weird artifacts)

Lingua principale
Python
Stelle
13
Fork
9
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Guida per i contributori

Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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