Add voltage collages to BluePyMM

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Evaluación

Dificultad
4/5
Tiempo estimado
3-5 días
Aptitud para principiantes
35/100
Tipo de issue
Nueva funcionalidad
Claridad
Bastante claro
Estado de actividad
Estancado
Stack tecnológico
python
Área
backend, data-visualization

Línea de trabajo

No se nombra ningún archivo ni prueba. Empieza por seguir el flujo de trabajo de BluePyMM que genera trazas de voltaje de células de muestra y, después, determina dónde se puede añadir la reinyección de las corrientes umbral y de mantenimiento, y cómo se deben producir los collages. La tarea estará terminada cuando las salidas representativas del neocórtex se puedan revisar visualmente para detectar fallos y artefactos de eFEL.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

We should add a step that generates voltage collages of the traces generated by a sample of the cells.

E.g. for neocortex it would be useful to reinject the threshold / holding current in the cells and plot the output.

This way a human can check if everything is working correctly. (and if e.g. eFEL is not creating any weird artifacts)

Lenguaje dominante
Python
Estrellas
13
Forks
9
Sin PR fusionados en 30 d

Guía de contribución

No hay ninguna guía de contribución indexada para este repositorio

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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